238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02889 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_1502  flagellar MS-ring protein  62.57 
 
 
563 aa  701    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  73.16 
 
 
568 aa  870    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02889  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
564 aa  1144    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  53.94 
 
 
568 aa  600  1e-170  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  53.36 
 
 
560 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  53.36 
 
 
560 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  53.53 
 
 
560 aa  590  1e-167  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  53.18 
 
 
560 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  53.71 
 
 
560 aa  585  1e-166  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1342  flagellar MS-ring protein  54.24 
 
 
561 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.505742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1361  flagellar MS-ring protein  51.91 
 
 
566 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1282  flagellar MS-ring protein  54.4 
 
 
561 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1349  flagellar MS-ring protein  54.4 
 
 
561 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  54.55 
 
 
553 aa  571  1e-161  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3066  flagellar MS-ring protein  53.75 
 
 
569 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2297  flagellar MS-ring protein  54.18 
 
 
565 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1324  flagellar MS-ring protein  53.09 
 
 
566 aa  560  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1366  flagellar MS-ring protein  54.05 
 
 
565 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1182  flagellar MS-ring protein  53.38 
 
 
558 aa  558  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03162  flagellar MS-ring protein  49.73 
 
 
580 aa  525  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002815  flagellar M-ring protein FliF  49.73 
 
 
580 aa  526  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1717  flagellar MS-ring protein  48.84 
 
 
580 aa  499  1e-140  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.869782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  34.44 
 
 
594 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  33.94 
 
 
594 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  34.38 
 
 
592 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  34.2 
 
 
592 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  33.61 
 
 
595 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  35.9 
 
 
558 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  34.2 
 
 
592 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  34.09 
 
 
597 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  33.85 
 
 
598 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  34 
 
 
592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  31.83 
 
 
561 aa  299  8e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  34.59 
 
 
544 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  33.69 
 
 
544 aa  295  1e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  33.63 
 
 
556 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  33.28 
 
 
594 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  34.3 
 
 
567 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  32.42 
 
 
552 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  32.36 
 
 
548 aa  276  5e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  31.31 
 
 
568 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  33.21 
 
 
552 aa  273  6e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  31.32 
 
 
574 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  31.32 
 
 
574 aa  271  2e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  33.27 
 
 
600 aa  251  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  29.56 
 
 
590 aa  249  7e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  35.42 
 
 
594 aa  243  5e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  33.08 
 
 
603 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  30.68 
 
 
595 aa  240  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.35 
 
 
587 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  31.44 
 
 
580 aa  235  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  31.09 
 
 
568 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  31.02 
 
 
587 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  31.02 
 
 
587 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  31.02 
 
 
587 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  31.05 
 
 
587 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.44 
 
 
587 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 
567 aa  221  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
593 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 
569 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.98 
 
 
579 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  31.18 
 
 
579 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  30.98 
 
 
579 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  30.98 
 
 
579 aa  217  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  31.18 
 
 
576 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  30.07 
 
 
552 aa  216  9e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  30.07 
 
 
552 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  30.07 
 
 
552 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  30.07 
 
 
552 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  30.07 
 
 
552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  31.52 
 
 
571 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  29.89 
 
 
552 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  30.23 
 
 
587 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  29.33 
 
 
567 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  31.54 
 
 
611 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  31.54 
 
 
611 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1576  flagellar MS-ring protein  30.95 
 
 
568 aa  209  7e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  28.16 
 
 
583 aa  209  1e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  33.76 
 
 
560 aa  209  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  31.24 
 
 
584 aa  208  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  31.13 
 
 
611 aa  207  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  28.85 
 
 
582 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  31.81 
 
 
598 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  28.49 
 
 
569 aa  207  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  30.21 
 
 
598 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  31.81 
 
 
598 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  29.91 
 
 
548 aa  207  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  30.45 
 
 
570 aa  207  5e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  30.02 
 
 
677 aa  207  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  30.45 
 
 
570 aa  207  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  29.74 
 
 
565 aa  207  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  29.95 
 
 
563 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3112  flagellar FliF M-ring protein  28.25 
 
 
527 aa  206  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  30.45 
 
 
570 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.58 
 
 
598 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.58 
 
 
598 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.58 
 
 
598 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.58 
 
 
598 aa  205  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  28.82 
 
 
570 aa  204  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  28.93 
 
 
566 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>