239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1618 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3066  flagellar MS-ring protein  88.4 
 
 		 569 aa  957    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  80.04 
 
 		 553 aa  871    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  78.8 
 
 		 560 aa  901    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1324  flagellar MS-ring protein  74.96 
 
 		 566 aa  847    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  78.8 
 
 		 560 aa  901    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1282  flagellar MS-ring protein  79.01 
 
 		 561 aa  884    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1349  flagellar MS-ring protein  79.01 
 
 		 561 aa  884    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1182  flagellar MS-ring protein  75.58 
 
 		 558 aa  828    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1342  flagellar MS-ring protein  79.54 
 
 		 561 aa  886    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1361  flagellar MS-ring protein  77.82 
 
 		 566 aa  894    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2297  flagellar MS-ring protein  74.96 
 
 		 565 aa  815    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  78.62 
 
 		 560 aa  899    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 568 aa  1154    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  78.98 
 
 		 560 aa  902    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1366  flagellar MS-ring protein  80.25 
 
 		 565 aa  894    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  79.68 
 
 		 560 aa  904    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  54.82 
 
 		 568 aa  628  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02889  flagellar MS-ring protein  53.94 
 
 		 564 aa  592  1e-168  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1502  flagellar MS-ring protein  53.05 
 
 		 563 aa  576  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002815  flagellar M-ring protein FliF  46.49 
 
 		 580 aa  464  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03162  flagellar MS-ring protein  45.74 
 
 		 580 aa  456  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1717  flagellar MS-ring protein  46.96 
 
 		 580 aa  458  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.869782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  35.83 
 
 		 594 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  35.83 
 
 		 594 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  34.27 
 
 		 592 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  34.27 
 
 		 592 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  34.49 
 
 		 592 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  32.62 
 
 		 561 aa  301  2e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  32.68 
 
 		 544 aa  295  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  35.11 
 
 		 552 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  32.86 
 
 		 544 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  34.43 
 
 		 595 aa  290  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  35.32 
 
 		 568 aa  286  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  35.06 
 
 		 558 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  35.15 
 
 		 567 aa  283  5.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  32.77 
 
 		 597 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  34.72 
 
 		 592 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  32.61 
 
 		 598 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  34.06 
 
 		 556 aa  276  5e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  33.74 
 
 		 594 aa  276  9e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  34.23 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  35.2 
 
 		 580 aa  261  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  31.96 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  31.96 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  34.03 
 
 		 590 aa  257  3e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  32.55 
 
 		 595 aa  254  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  35.71 
 
 		 594 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  32.89 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  30.25 
 
 		 566 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  31.99 
 
 		 587 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  31.28 
 
 		 569 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  30.5 
 
 		 583 aa  223  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  31.26 
 
 		 603 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.89 
 
 		 600 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  29.89 
 
 		 548 aa  219  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  31.21 
 
 		 611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  31.21 
 
 		 611 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  33.91 
 
 		 568 aa  216  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  33.56 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  33.56 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  33.56 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  32.26 
 
 		 587 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  33.56 
 
 		 552 aa  213  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  33.56 
 
 		 552 aa  213  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.3 
 
 		 579 aa  213  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  29.68 
 
 		 593 aa  212  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  31.88 
 
 		 587 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  33.56 
 
 		 552 aa  213  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1641  flagellar M-ring protein FliF  33.41 
 
 		 572 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178622  normal  0.771793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 		 579 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 		 576 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 		 579 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 		 579 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  31.5 
 
 		 567 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  31.53 
 
 		 571 aa  211  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  30.28 
 
 		 570 aa  209  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  30.82 
 
 		 611 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 		 587 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 		 587 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  33.41 
 
 		 587 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0222  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  207  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.88735  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0417  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  207  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0664966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  32.21 
 
 		 677 aa  207  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  28.16 
 
 		 582 aa  206  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0234  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  207  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3281  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.481316  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  31.74 
 
 		 563 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2946  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.945796  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2142  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3400  flagellar MS-ring protein  31.98 
 
 		 598 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  33.71 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  30.91 
 
 		 558 aa  204  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  31.81 
 
 		 570 aa  204  4e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  31.81 
 
 		 570 aa  204  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  31.93 
 
 		 576 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  32.41 
 
 		 584 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  31.81 
 
 		 570 aa  201  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  30.94 
 
 		 558 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  30.37 
 
 		 576 aa  199  9e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3304  flagellar M-ring protein FliF  29.3 
 
 		 530 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>