247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3228 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  100 
 
 		 553 aa  1128    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3066  flagellar MS-ring protein  82.97 
 
 		 569 aa  881    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  80.04 
 
 		 568 aa  895    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  92.75 
 
 		 560 aa  1026    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  92.75 
 
 		 560 aa  1026    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1324  flagellar MS-ring protein  82.45 
 
 		 566 aa  885    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  55.23 
 
 		 568 aa  636    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1282  flagellar MS-ring protein  97.47 
 
 		 561 aa  1043    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1349  flagellar MS-ring protein  97.47 
 
 		 561 aa  1043    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1182  flagellar MS-ring protein  80.43 
 
 		 558 aa  874    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1361  flagellar MS-ring protein  78.21 
 
 		 566 aa  866    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1342  flagellar MS-ring protein  96.56 
 
 		 561 aa  1038    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  92.75 
 
 		 560 aa  1026    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2297  flagellar MS-ring protein  79.49 
 
 		 565 aa  857    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  93.84 
 
 		 560 aa  1015    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  92.75 
 
 		 560 aa  1027    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1366  flagellar MS-ring protein  80.76 
 
 		 565 aa  855    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02889  flagellar MS-ring protein  54.55 
 
 		 564 aa  581  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1502  flagellar MS-ring protein  53.58 
 
 		 563 aa  580  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002815  flagellar M-ring protein FliF  47.87 
 
 		 580 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03162  flagellar MS-ring protein  46.94 
 
 		 580 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1717  flagellar MS-ring protein  46.76 
 
 		 580 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.869782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  35.02 
 
 		 594 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  35.19 
 
 		 594 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  33.7 
 
 		 561 aa  313  3.9999999999999997e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  34.27 
 
 		 592 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  34.62 
 
 		 592 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  34.62 
 
 		 592 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  32.97 
 
 		 544 aa  306  5.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  36.45 
 
 		 552 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  33.15 
 
 		 544 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  34.2 
 
 		 595 aa  301  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  34.92 
 
 		 558 aa  294  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  36.2 
 
 		 567 aa  291  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  33.28 
 
 		 597 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  33.45 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  33.68 
 
 		 592 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  35.56 
 
 		 552 aa  286  9e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  33.39 
 
 		 568 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  32.15 
 
 		 556 aa  279  7e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  33.04 
 
 		 594 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  31.6 
 
 		 548 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  32.06 
 
 		 574 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  32.06 
 
 		 574 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  33.81 
 
 		 580 aa  253  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  30.51 
 
 		 595 aa  248  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  34.47 
 
 		 590 aa  243  1e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  32.06 
 
 		 566 aa  232  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  30.31 
 
 		 579 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  30.31 
 
 		 579 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  30.31 
 
 		 576 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  29.14 
 
 		 570 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  30.13 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3476  flagellar MS-ring protein  32.54 
 
 		 558 aa  217  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  30.13 
 
 		 579 aa  217  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.74 
 
 		 600 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  30.04 
 
 		 569 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  29.89 
 
 		 568 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  30.77 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  30.77 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  30.77 
 
 		 552 aa  212  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  29.98 
 
 		 587 aa  212  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  30.04 
 
 		 583 aa  212  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  29.72 
 
 		 603 aa  211  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  30.77 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  30.77 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  30.77 
 
 		 552 aa  211  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  28.83 
 
 		 570 aa  209  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  29.85 
 
 		 611 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  29.85 
 
 		 611 aa  209  7e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  28.83 
 
 		 570 aa  209  7e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  32.4 
 
 		 548 aa  209  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  33.33 
 
 		 563 aa  207  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  34.59 
 
 		 576 aa  207  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  29.72 
 
 		 611 aa  206  9e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  32.24 
 
 		 569 aa  205  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  28.83 
 
 		 570 aa  203  7e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0773  flagellar MS-ring protein  31.2 
 
 		 584 aa  202  9e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.32 
 
 		 587 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.13 
 
 		 587 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  29.49 
 
 		 582 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  31.1 
 
 		 576 aa  200  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1641  flagellar M-ring protein FliF  33.48 
 
 		 572 aa  200  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178622  normal  0.771793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  30.34 
 
 		 571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3979  flagellar MS-ring protein  31.03 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.697523  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  31.13 
 
 		 593 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 		 587 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 		 587 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  29.94 
 
 		 587 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2529  flagellar MS-ring protein  31.87 
 
 		 565 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  29.72 
 
 		 567 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  29.66 
 
 		 677 aa  197  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2947  flagellar MS-ring protein  33.96 
 
 		 563 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1287  flagellar M-ring protein FliF  33.49 
 
 		 578 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.930135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  30.06 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3659  flagellar MS-ring protein  31.5 
 
 		 565 aa  194  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  29.55 
 
 		 567 aa  193  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  34.62 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  30.02 
 
 		 587 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0053  flagellar FliF M-ring protein  34.51 
 
 		 570 aa  192  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>