235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1361 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3068  flagellar MS-ring protein  78.47 
 
 
560 aa  889    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.739172 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3228  flagellar MS-ring protein  78.21 
 
 
553 aa  851    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1437  flagellar MS-ring protein  78.29 
 
 
560 aa  888    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1618  flagellar MS-ring protein  77.82 
 
 
568 aa  900    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1324  flagellar MS-ring protein  76.18 
 
 
566 aa  836    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1282  flagellar MS-ring protein  77.26 
 
 
561 aa  856    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1349  flagellar MS-ring protein  77.26 
 
 
561 aa  856    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1182  flagellar MS-ring protein  74.46 
 
 
558 aa  823    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1342  flagellar MS-ring protein  77.26 
 
 
561 aa  855    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.505742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3066  flagellar MS-ring protein  79.44 
 
 
569 aa  868    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2936  flagellar MS-ring protein  78.29 
 
 
560 aa  888    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2297  flagellar MS-ring protein  71.91 
 
 
565 aa  795    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1361  flagellar MS-ring protein  100 
 
 
566 aa  1152    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2926  flagellar MS-ring protein  78.65 
 
 
560 aa  890    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1366  flagellar MS-ring protein  77.68 
 
 
565 aa  863    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2576  flagellar MS-ring protein  78.47 
 
 
560 aa  876    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.108144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3047  flagellar MS-ring protein  53.89 
 
 
568 aa  632  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.733751  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1502  flagellar MS-ring protein  52.19 
 
 
563 aa  573  1.0000000000000001e-162  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02889  flagellar MS-ring protein  51.91 
 
 
564 aa  574  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002815  flagellar M-ring protein FliF  45.12 
 
 
580 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03162  flagellar MS-ring protein  43.76 
 
 
580 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1717  flagellar MS-ring protein  44.1 
 
 
580 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.869782  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1498  flagellar MS-ring protein  34.57 
 
 
592 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.583587  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4369  flagellar MS-ring protein  34.57 
 
 
592 aa  319  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.443151  normal  0.963228 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1958  flagellar M-ring protein FliF  34.68 
 
 
594 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.714595  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3930  flagellar MS-ring protein  34.22 
 
 
592 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.105617  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3457  flagellar MS-ring protein  34.38 
 
 
594 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1442  flagellar M-ring protein FliF  32.97 
 
 
561 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1536  flagellar MS-ring protein  34.4 
 
 
595 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1969  flagellar FliF M-ring protein  35.78 
 
 
552 aa  301  2e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2359  flagellar FliF M-ring protein  35.1 
 
 
567 aa  292  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1724  flagellar MS-ring protein  32.66 
 
 
544 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50140  flagellar MS-ring protein  33.22 
 
 
598 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000736226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3694  flagellar MS-ring protein  34.56 
 
 
592 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4270  flagellar MS-ring protein  33.05 
 
 
597 aa  289  7e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.113236  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2825  flagellar MS-ring protein  32.5 
 
 
594 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.676627  normal  0.0163238 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1724  flagellar MS-ring protein  32.66 
 
 
544 aa  286  5e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3448  flagellar MS-ring protein  33.09 
 
 
558 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1158  flagellar M-ring protein FliF  34.49 
 
 
552 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.622292  hitchhiker  0.00313457 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1997  flagellar MS-ring protein  32.98 
 
 
568 aa  266  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.27739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2188  flagellar MS-ring protein  31.34 
 
 
556 aa  265  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0498  flagellar M-ring protein FliF  32.85 
 
 
595 aa  264  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.774249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0709  flagellar M-ring protein FliF  34.22 
 
 
580 aa  259  8e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109736  normal  0.594992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06185  flagellar MS-ring protein  32.26 
 
 
574 aa  259  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000901294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00981  flagellar MS-ring protein  32.26 
 
 
574 aa  259  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.497282  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1880  flagellar MS-ring protein  31.56 
 
 
548 aa  251  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.364366  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0433  flagellar M-ring protein FliF  34.05 
 
 
590 aa  247  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.186559  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1955  flagellar M-ring protein FliF  34.49 
 
 
594 aa  243  6e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4731  flagellar M-ring protein FliF  31.14 
 
 
611 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.722282  normal  0.0591496 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3654  flagellar M-ring protein FliF  31.14 
 
 
611 aa  224  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.238137 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1600  flagellar MS-ring protein  30.43 
 
 
548 aa  218  2e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.320993 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24230  flagellar M-ring protein  33.85 
 
 
576 aa  217  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6413  flagellar MS-ring protein  30.55 
 
 
587 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.340617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0166  flagellar MS-ring protein  30.2 
 
 
600 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.710453 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3565  flagellar MS-ring protein  28.07 
 
 
582 aa  214  4.9999999999999996e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2931  flagellar MS-ring protein  29.37 
 
 
593 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1345  flagellar MS-ring protein  31.12 
 
 
567 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0083  flagellar MS-ring protein  28.99 
 
 
566 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1016  flagellar M-ring protein FliF  29.9 
 
 
576 aa  210  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001186  flagellar M-ring protein FliF  29.79 
 
 
569 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3770  flagellar MS-ring protein  29.34 
 
 
603 aa  209  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.448077 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0390  flagellar M-ring transmembrane protein  29.68 
 
 
611 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1287  flagellar M-ring protein FliF  33.1 
 
 
578 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.930135  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2290  flagellar MS-ring protein  28.36 
 
 
570 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04973  flagellar MS-ring protein  29.19 
 
 
583 aa  206  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2014  flagellar MS-ring protein  28.36 
 
 
570 aa  206  1e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.410947  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1641  flagellar M-ring protein FliF  31.76 
 
 
572 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178622  normal  0.771793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5097  flagellar MS-ring protein  29.76 
 
 
568 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0565  flagellar biosynthesis lipoprotein  31.19 
 
 
567 aa  204  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3109  flagellar MS-ring protein  30.51 
 
 
587 aa  203  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5261  flagellar MS-ring protein  31.87 
 
 
563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.046681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2899  flagellar MS-ring protein  32.2 
 
 
571 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00622056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1710  flagellar M-ring protein FliF  31.64 
 
 
552 aa  201  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.136668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1246  flagellar MS-ring protein  31.64 
 
 
552 aa  201  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2038  flagellar MS-ring protein  31.64 
 
 
552 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2391  flagellar MS-ring protein  28.36 
 
 
570 aa  200  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2975  flagellar MS-ring protein  30.13 
 
 
587 aa  200  5e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260042 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1704  flagellar MS-ring protein  31.64 
 
 
552 aa  200  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2185  flagellar MS-ring protein  29.21 
 
 
579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.156364 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2131  flagellar MS-ring protein  29.21 
 
 
579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000362191 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1273  flagellar MS-ring protein  29.21 
 
 
576 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.904513 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2127  flagellar MS-ring protein  29.21 
 
 
579 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.152007  normal  0.244786 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2171  flagellar MS-ring protein  31.18 
 
 
552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.510542  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2714  flagellar MS-ring protein  32.42 
 
 
552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.586754 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1150  flagellar MS-ring protein  29.21 
 
 
579 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0672895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3083  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 
587 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869845  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2450  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 
587 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0278408  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3064  flagellar MS-ring protein  30.11 
 
 
587 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.112496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0638  flagellar M-ring protein FliF  30.34 
 
 
566 aa  197  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0077  flagellar MS-ring protein  29.42 
 
 
570 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4213  flagellar M-ring protein FliF  28.18 
 
 
525 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3061  flagellar MS-ring protein  31.84 
 
 
587 aa  194  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1540  flagellar MS-ring protein  28.65 
 
 
569 aa  193  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3081  flagellar M-ring protein FliF  31.35 
 
 
564 aa  193  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0053  flagellar FliF M-ring protein  32.65 
 
 
570 aa  193  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3807  flagellar M-ring protein FliF  31.83 
 
 
564 aa  192  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.612856  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0200  flagellar MS-ring protein  31.15 
 
 
677 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4168  flagellar MS-ring protein  30.6 
 
 
560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0550  flagellar M-ring protein FliF  30.52 
 
 
588 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4395  flagellar M-ring protein FliF  32.45 
 
 
566 aa  190  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>