143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2009 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 301 aa  584  1e-166  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  67.56 
 
 		 301 aa  381  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  68.46 
 
 		 298 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  66.11 
 
 		 301 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  58.72 
 
 		 301 aa  324  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  48.99 
 
 		 302 aa  267  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  42.33 
 
 		 300 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  39.08 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  37.76 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  37.76 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  37.76 
 
 		 299 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  37.76 
 
 		 299 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  37.76 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  37.76 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  37.76 
 
 		 337 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  39.4 
 
 		 300 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  38.33 
 
 		 306 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  37.58 
 
 		 302 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  37.71 
 
 		 302 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  36.79 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  41.03 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  36.43 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  35.4 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  33.67 
 
 		 302 aa  150  3e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.24 
 
 		 302 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.23 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  26.16 
 
 		 302 aa  92.4  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.37 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  25.81 
 
 		 301 aa  89.7  5e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  25.67 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  25.33 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  28.31 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  30.6 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  24.81 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  28.52 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  25.62 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  27.68 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  26.74 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  23.53 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  23.2 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  22.95 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  23.78 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  23.84 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  24.28 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.28 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  24.42 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  24.83 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  23.78 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  28.91 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  23.49 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  24.52 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  22.46 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  24.64 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  24.1 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  24.1 
 
 		 318 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0560  permeases-like  31.33 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00020008  normal  0.118389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  23.78 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  23.83 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  26.51 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0520  Auxin Efflux Carrier  27.75 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000302523  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  28.18 
 
 		 318 aa  54.3  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  22.91 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  24.14 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  27.06 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  25.84 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  28.17 
 
 		 324 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  25.9 
 
 		 296 aa  52.8  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  23.46 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  23.89 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.24 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 313 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  26.07 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  26.64 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.88 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  23.46 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.54 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  24.75 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  21.86 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  24.48 
 
 		 297 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  28.64 
 
 		 337 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  23.41 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  24.24 
 
 		 296 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  25.42 
 
 		 315 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  22.57 
 
 		 321 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  29.18 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  24.67 
 
 		 313 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.28 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.28 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>