More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3481 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 189 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 220 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 196 aa  92.8  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1789  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00598195  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13490  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  22.38 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  46.75 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 287 aa  52.4  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 181 aa  51.2  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  26.67 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3875  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5248  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.66171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  34.44 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  39.29 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 256 aa  48.9  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 205 aa  48.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 228 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  32.19 
 
 		 217 aa  48.1  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 203 aa  47.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 424 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  32.5 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  25.37 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  34.33 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 305 aa  47  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>