66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2031 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2031  conjugal transfer protein TrbJ  100 
 
 		 242 aa  463  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.390142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1839  conjugal transfer protein TrbJ  46.69 
 
 		 241 aa  196  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.835985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0730  conjugal transfer protein TrbJ  47.93 
 
 		 247 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2580  conjugal transfer protein TrbJ  46.08 
 
 		 245 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2354  conjugal transfer protein TrbJ  45.85 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00542986  normal  0.35114 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35680  conjugal transfer protein TrbJ  44.24 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1286  conjugal transfer protein TrbJ  41.74 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3502  conjugal transfer protein TrbJ  44.89 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1009  conjugal transfer protein TrbJ  41.32 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2695  conjugal transfer protein TrbJ  44.89 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.833269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1320  conjugal transfer protein TrbJ  45.24 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1554  conjugal transfer protein TrbJ  44.29 
 
 		 241 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000179066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1144  conjugal transfer protein TrbJ  46.23 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4199  conjugal transfer protein TrbJ  41.82 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.481376  normal  0.72742 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2649  conjugal transfer protein TrbJ  41.42 
 
 		 251 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2008  conjugal transfer protein TrbJ  45.87 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.589557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2907  conjugal transfer protein TrbJ  43.93 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.450619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0745  conjugal transfer protein TrbJ  45.87 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0505  conjugal transfer protein TrbJ  43.9 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00617649  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2882  conjugal transfer protein TrbJ  43.27 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0488522  normal  0.0400319 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3216  conjugal transfer protein TrbJ  44.02 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.377133  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0599  conjugal transfer protein TrbJ  43.27 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.633648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3855  conjugal transfer protein TrbJ  41.96 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00466031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2320  conjugal transfer protein TrbJ  40.82 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.570839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7745  conjugal transfer protein TrbJ  43.78 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662421 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1345  conjugal transfer protein TrbJ  45.16 
 
 		 245 aa  138  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.457105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3897  conjugal transfer protein TrbJ  41.84 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.227906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0434  conjugal transfer protein TrbJ  45.22 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.856539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3702  conjugal transfer protein TrbJ  44.78 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.202804  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0165  conjugal transfer protein TrbJ  43.66 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.440181  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30900  conjugal transfer protein TrbJ  44.78 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000007788  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1899  conjugal transfer protein TrbJ  44.78 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.668974  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2096  conjugal transfer protein TrbJ  39.91 
 
 		 249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1480  conjugal transfer protein TrbJ  40.17 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.10056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3545  conjugal transfer protein TrbJ  39.58 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1190  conjugal transfer protein TrbJ  39.58 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1504  conjugal transfer protein TrbJ  42.79 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2828  conjugal transfer protein TrbJ  40.55 
 
 		 245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7444  conjugal transfer protein TrbJ  40.17 
 
 		 248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.605496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0695  conjugal transfer protein TrbJ  41.07 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3090  conjugal transfer protein TrbJ  42.21 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3198  conjugal transfer protein TrbJ  39.43 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3537  conjugal transfer protein TrbJ  43.58 
 
 		 245 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3996  conjugal transfer protein TrbJ  44.3 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3000  conjugal transfer protein TrbJ  42.61 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0152  conjugal transfer protein TrbJ  40.09 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3831  conjugal transfer protein TrbJ  41.77 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0323585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0962  conjugal transfer protein TrbJ  41.94 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3368  conjugal transfer protein TrbJ  39.45 
 
 		 245 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2272  conjugal transfer protein TrbJ  40.43 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2482  conjugal transfer protein TrbJ  40.91 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.19296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0314  conjugal transfer protein TrbJ  38.75 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3695  conjugal transfer protein TrbJ  44 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2610  conjugal transfer protein TrbJ  40.17 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5371  P-type conjugative transfer protein TrbJ  29.52 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2350  P-type conjugative transfer protein TrbJ  24.54 
 
 		 252 aa  53.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4749  hypothetical protein  25.94 
 
 		 257 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695335  normal  0.293585 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3572  conjugal transfer TrbJ signal peptide protein  26.48 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000309326  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5486  conjugal transfer protein TrbJ  27.65 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0871579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5219  putative conjugal transfer protein TrbJ  32.57 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9263  conjugal transfer protein TrbJ  24.09 
 
 		 269 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0761  P-type conjugative transfer protein TrbJ  21.72 
 
 		 258 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8330  conjugal transfer protein TrbJ  25.22 
 
 		 269 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0931195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2347  P-type conjugative transfer protein TrbJ  26.47 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2538  conjugal transfer protein TrbJ  29.67 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0724206  hitchhiker  0.0000648987 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9655  conjugal transfer protein TrbJ  27.44 
 
 		 262 aa  42.4  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.279512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>