More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5781 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5781  transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 895 aa  1725    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1095  transcriptional regulator, LuxR family  44 
 
 		 919 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.860504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  30.54 
 
 		 998 aa  267  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2089  transcriptional regulator, LuxR family  28.69 
 
 		 959 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.840433 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2245  transcriptional regulator, LuxR family  31.63 
 
 		 956 aa  159  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.00000425814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3154  transcriptional regulator, LuxR family  25.94 
 
 		 1089 aa  146  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.639432 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1998  transcriptional regulator, LuxR family  28.79 
 
 		 956 aa  138  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0120259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3490  LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 950 aa  89.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123756  normal  0.368778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2880  transcriptional regulator, LuxR family  28.35 
 
 		 905 aa  74.3  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0349194  hitchhiker  0.00245203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  27.59 
 
 		 947 aa  71.6  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3197  transcriptional regulator, LuxR family  59.65 
 
 		 876 aa  69.7  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6796  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 1118 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4346  LuxR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 1030 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4474  regulatory protein, LuxR  26.05 
 
 		 977 aa  67.4  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0017385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2326  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.76 
 
 		 981 aa  66.6  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645479 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5349  transcriptional regulator, LuxR family  31.74 
 
 		 900 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0835513  normal  0.0775284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2954  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  27.03 
 
 		 1146 aa  65.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00262132  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2905  transcriptional regulator, LuxR family  52.73 
 
 		 335 aa  66.2  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3668  response regulator receiver protein  55.56 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.563914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5144  transcriptional regulator, LuxR family  35.58 
 
 		 918 aa  64.7  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0156919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4479  regulatory protein, LuxR  59.62 
 
 		 865 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00441631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2417  transcriptional regulator, LuxR family  38.26 
 
 		 998 aa  64.7  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0109186  decreased coverage  0.00199562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  46.03 
 
 		 925 aa  64.7  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0222  transcriptional regulator, LuxR family  35.17 
 
 		 918 aa  64.7  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.847237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35370  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  55.56 
 
 		 881 aa  63.9  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.705533  normal  0.60935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0207  transcriptional regulator, LuxR family  46.32 
 
 		 435 aa  64.3  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.314415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0773  transcriptional regulator, LuxR family  26.01 
 
 		 967 aa  63.9  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0926  transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 999 aa  64.3  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0365  two component LuxR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 199 aa  63.9  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.210231  normal  0.243335 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1298  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.23 
 
 		 228 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.70055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3561  transcriptional regulator, LuxR family  47.62 
 
 		 908 aa  62.8  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1005  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.86 
 
 		 211 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1440  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.89 
 
 		 208 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.12 
 
 		 220 aa  62  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3795  ATPase-like protein  30.66 
 
 		 925 aa  62.4  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.978971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1210  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.48 
 
 		 889 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.603589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0068  regulatory protein LuxR  57.69 
 
 		 867 aa  62.4  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289946  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3893  transcriptional regulator, LuxR family  48.39 
 
 		 904 aa  62  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0612  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  62  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.105579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 781 aa  62  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4065  response regulator receiver protein  44.57 
 
 		 864 aa  62  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206312  normal  0.538479 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1778  regulatory protein, LuxR  41.33 
 
 		 917 aa  60.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_934  DNA-binding response regulator, LuxR family  50.68 
 
 		 232 aa  60.8  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.717523  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1148  regulatory protein LuxR  41.35 
 
 		 921 aa  60.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  49.28 
 
 		 227 aa  60.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8709  ATPase-like protein  53.33 
 
 		 928 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3139  transcriptional regulator, LuxR family  57.14 
 
 		 879 aa  59.7  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00942978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 1015 aa  60.1  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  25.54 
 
 		 1067 aa  60.1  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0947  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 799 aa  60.1  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4976  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 218 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.289575  normal  0.034027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1221  LuxR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 910 aa  59.3  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  47.89 
 
 		 213 aa  59.3  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4029  ATPase-like protein  45.07 
 
 		 758 aa  59.7  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00633058  normal  0.086403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2725  transcriptional regulator, LuxR family  45.65 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3175  response regulator receiver protein  48.21 
 
 		 250 aa  59.3  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000721008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  45.95 
 
 		 913 aa  58.9  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4559  LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 877 aa  58.9  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  19.41 
 
 		 1147 aa  58.9  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0072  transcriptional activator domain protein  28.2 
 
 		 1101 aa  58.9  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.713941  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0243  regulatory protein, LuxR  51.85 
 
 		 884 aa  58.9  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2325  regulatory protein LuxR  42.86 
 
 		 923 aa  58.9  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2489  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.15 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.526711  normal  0.682115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1126  transcriptional regulator, LuxR family  41.05 
 
 		 951 aa  58.9  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.590234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5515  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 879 aa  58.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0430285  normal  0.701277 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4222  ATP-dependent transcription regulator LuxR  47.06 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.157864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.95 
 
 		 1150 aa  58.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3178  transcriptional regulator, LuxR family  48.48 
 
 		 1074 aa  58.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00421599  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2323  regulatory protein LuxR  36 
 
 		 955 aa  58.2  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17030  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  56.9 
 
 		 907 aa  58.2  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.758711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5165  two component LuxR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.162111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6795  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 889 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.26152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26510  transcriptional regulator, luxR family  50 
 
 		 903 aa  58.2  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.427696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  43.66 
 
 		 870 aa  58.2  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  44.78 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0648  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.08 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05152  protein-glutamate methylesterase  44.07 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1222  LuxR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 926 aa  58.2  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1291  transcriptional regulator, LuxR family  38.85 
 
 		 912 aa  57.8  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000111184 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02400  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  45.76 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0894  putative outer membrane component of efflux system  44.07 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00401485  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4437  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.33 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.784745  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26831  LuxR transcriptional regulator  41.43 
 
 		 92 aa  57.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.67 
 
 		 1055 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1068  transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 966 aa  57.8  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3459  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  45.88 
 
 		 901 aa  57.4  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000984222  hitchhiker  0.00326143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0324  transcriptional regulator, LuxR family  56.86 
 
 		 938 aa  57.4  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3380  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.23 
 
 		 222 aa  57  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 215 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2042  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  48.08 
 
 		 947 aa  57  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0920  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 880 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563129  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.24 
 
 		 221 aa  57.4  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5915  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.7 
 
 		 207 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00974735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2291  regulatory protein LuxR  46.88 
 
 		 934 aa  57.4  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>