141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3660 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  396  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 231 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  32.17 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 408 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2512  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290305  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3660  resolvase domain-containing protein  43.75 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1245  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  25 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1240  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 237 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 188 aa  45.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.92 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.92 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.92 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.92 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.92 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  31.37 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 212 aa  44.7  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  47.92 
 
 		 217 aa  44.7  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 195 aa  45.1  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 193 aa  44.7  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  44.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  44.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  44.9 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 400 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  25.87 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0885  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 340 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  32.43 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0589  hypothetical protein  38.46 
 
 		 341 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.684153  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0699  hypothetical protein  38.46 
 
 		 338 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.299256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2102  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 333 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0307267  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2007  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 341 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.820101  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1654  hypothetical protein  38.46 
 
 		 338 aa  43.1  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.900303  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0516  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 378 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.477479  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>