More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1240 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1240  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0758  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00251208 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5813  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 243 aa  53.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393234  hitchhiker  0.00386056 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  30.59 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 236 aa  51.6  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  24.64 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0995  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1159  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1237  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 260 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 196 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  30.95 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.33 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 87 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2564  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.454515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.33 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.33 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  26.5 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  34.02 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  34.02 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  21.9 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  34.02 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  34.02 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  34.02 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  34.02 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  34.02 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  34.02 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1393  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.661714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  34.15 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>