More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2136 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 212 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  50.3 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 206 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 201 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 295 aa  149  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 235 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  46.81 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  43.85 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  41.85 
 
 		 223 aa  141  8e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 223 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 223 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 223 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 223 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 242 aa  72  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 191 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  32 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  24.5 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.54 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1728  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 72 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  40.58 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4449  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 400 aa  54.3  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 412 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 412 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.93 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  47.92 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4457  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4544  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 412 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4839  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0941729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 188 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>