292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1442 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 167 aa  332  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  62.9 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  48.24 
 
 		 220 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 196 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 		 183 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  43.71 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 		 195 aa  95.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  52.63 
 
 		 208 aa  94.7  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 224 aa  90.1  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 200 aa  89.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  40.67 
 
 		 192 aa  88.2  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  39.16 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  50.5 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  47.87 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  41.94 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 216 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 230 aa  57.8  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 196 aa  52  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 217 aa  51.6  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 181 aa  50.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 241 aa  50.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 270 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  40.85 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 186 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 213 aa  48.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  47.8  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 201 aa  47.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 227 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 230 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 225 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 230 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 244 aa  47.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 186 aa  47.4  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  39.13 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 231 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 257 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  55.32 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0836  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  48 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 185 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 231 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 227 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 227 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  35.59 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 420 aa  45.4  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 223 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  35.58 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 208 aa  45.1  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 208 aa  45.1  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 228 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 223 aa  44.7  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 192 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 211 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 216 aa  44.7  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 202 aa  44.7  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4141  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 243 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 209 aa  44.3  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 211 aa  44.3  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 205 aa  44.7  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 213 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 199 aa  44.3  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 213 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 188 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 193 aa  44.3  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  46 
 
 		 202 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 240 aa  44.3  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 219 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  32.14 
 
 		 220 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>