268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04510 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE04510  isoprenoid biosynthesis-related protein, putative  100 
 
 		 374 aa  778    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89338  arnesyl diphosphate synthetase (FPP synthetase)  61.36 
 
 		 350 aa  441  9.999999999999999e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08012  polyprenyl synthetase (Eurofung)  59.01 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.149955  normal  0.151034 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34113  predicted protein  51.14 
 
 		 348 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.176681 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49325  predicted protein  50.15 
 
 		 343 aa  337  2.9999999999999997e-91  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  29.13 
 
 		 324 aa  96.3  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  26.38 
 
 		 321 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  27.69 
 
 		 324 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  32.71 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.5 
 
 		 360 aa  82  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  27.31 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.01 
 
 		 364 aa  77.8  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  28 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  27.67 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  28.67 
 
 		 375 aa  72.8  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  29.41 
 
 		 364 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  31.17 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  25.43 
 
 		 327 aa  72  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  28.89 
 
 		 332 aa  72  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  29.32 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  25.46 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  29.26 
 
 		 323 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  29.65 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  29.26 
 
 		 332 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25.09 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  25 
 
 		 322 aa  67  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  30.52 
 
 		 634 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.76 
 
 		 369 aa  66.6  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  27.44 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  28.3 
 
 		 357 aa  66.2  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  25.88 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  29.48 
 
 		 332 aa  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  28.89 
 
 		 364 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  29.5 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  25.78 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  26.86 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  26.05 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  28.09 
 
 		 360 aa  64.3  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  27.3 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  25.98 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  27 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0181  polyprenyl synthetase  29.47 
 
 		 334 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  26.44 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  26.83 
 
 		 384 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  26.12 
 
 		 349 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1678  Polyprenyl synthetase  30.93 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.252653  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  26.79 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  24.82 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0165  polyprenyl synthetase  27.99 
 
 		 334 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  26.99 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  26.03 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  27.9 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  29.58 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.67 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  24.77 
 
 		 347 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  27.65 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  26.88 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  26.55 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  25.23 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  24.55 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  24.15 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  24.55 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  26.58 
 
 		 371 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0392  Dimethylallyltranstransferase  28.14 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0147729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  28.3 
 
 		 376 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  28.77 
 
 		 317 aa  57  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  25.98 
 
 		 334 aa  57  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  25.95 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  26.35 
 
 		 1155 aa  56.2  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  22.53 
 
 		 319 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  24.09 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  27.96 
 
 		 359 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.19 
 
 		 361 aa  55.8  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0342  Polyprenyl synthetase  27.19 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.249196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  28.16 
 
 		 359 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  29.61 
 
 		 306 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  23.98 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  26.34 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.49 
 
 		 326 aa  55.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  29.61 
 
 		 306 aa  55.5  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  29.1 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  27.27 
 
 		 361 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  27.06 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  26.17 
 
 		 317 aa  53.9  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  28.28 
 
 		 372 aa  53.9  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0319  octaprenyl-diphosphate synthase  28.96 
 
 		 347 aa  54.3  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00046336  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  26.52 
 
 		 350 aa  53.9  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  26.45 
 
 		 330 aa  53.5  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0506  octylprenyl-diphosphate synthase  25.96 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282953  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  27.88 
 
 		 320 aa  53.5  0.000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3450  Polyprenyl synthetase  25.96 
 
 		 330 aa  53.1  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024256  hitchhiker  0.00543361 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  25.23 
 
 		 332 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  26.51 
 
 		 338 aa  53.1  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25.63 
 
 		 361 aa  53.1  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0088  octaprenyl-diphosphate synthase  25.5 
 
 		 325 aa  52  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.52685  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  24.53 
 
 		 322 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>