More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2516 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 219 aa  154  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  30.53 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1265  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 199 aa  87.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  26.9 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1436  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.940915  normal  0.193535 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 209 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02663  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0806616  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  20.65 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 271 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  29.55 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 185 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  42.31 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4472  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.590949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  23.13 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  26.32 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  22 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  38.18 
 
 		 226 aa  47.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  32.1 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  53.49 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 420 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0234  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3760  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.348424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  42.59 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>