More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3119 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5208  type III secretion FHIPEP protein  66.91 
 
 		 691 aa  877    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.231238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3119  putative membrane low calcium response protein, LcrD, Type III secretion  100 
 
 		 692 aa  1363    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.376971  hitchhiker  0.0044205 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0035  type III secretion protein LcrD  39.29 
 
 		 704 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003372  Type III secretion inner membrane channel protein  37.64 
 
 		 705 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01736  Type III secretory pathway, component EscV  36.67 
 
 		 705 aa  411  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1955  type III secretion inner membrane protein SctV  44.08 
 
 		 690 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0635  type III secretion inner membrane protein SctV  44.08 
 
 		 690 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1630  type III secretion inner membrane protein SctV  43.9 
 
 		 690 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2281  HrcV family type III secretion protein  43.9 
 
 		 690 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2198  HrcV family type III secretion protein  43.9 
 
 		 690 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.461572  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0679  type III secretion inner membrane protein SctV  43.77 
 
 		 1327 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0751  type III secretion inner membrane protein SctV  43.12 
 
 		 690 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.531496  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3008  HrcV family type III secretion protein  40.16 
 
 		 697 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.181145  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5641  HrcV family type III secretion protein  39.34 
 
 		 658 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.335669  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2415  type III secretion protein, HrcV family  39.23 
 
 		 696 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5931  HrcV family type III secretion protein  38.71 
 
 		 684 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.878766  normal  0.0843176 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5858  HrcV family type III secretion protein  39.4 
 
 		 658 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.664408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.68 
 
 		 686 aa  382  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0863  Hrp conserved HRCV transmembrane protein  37.69 
 
 		 690 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860177 
 
 
-
 
NC_002620  TC0365  type III secretion inner membrane protein SctV  35.57 
 
 		 708 aa  366  1e-100  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.371856  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5063  type III secretion protein, HrcV family  32.17 
 
 		 675 aa  367  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.34381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42500  type III secretory apparatus protein PcrD  38.01 
 
 		 706 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.22 
 
 		 697 aa  360  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.04 
 
 		 711 aa  360  7e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4147  type III secretion protein, HrcV family  32.37 
 
 		 686 aa  359  9.999999999999999e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0033977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2206  type III secretion protein, HrcV family  32.7 
 
 		 700 aa  357  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1891  type III secretion protein, HrcV family  33.19 
 
 		 700 aa  355  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4225  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.57 
 
 		 711 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  37.79 
 
 		 692 aa  354  4e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1215  Type III secretion protein HrcV  32.47 
 
 		 695 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.141393  normal  0.819529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.23 
 
 		 680 aa  352  8.999999999999999e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0452  HrcV family type III secretion protein  37.9 
 
 		 687 aa  352  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0695404  normal  0.158 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1905  HrcV family type III secretion protein  36.54 
 
 		 705 aa  351  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1997  HrcV family type III secretion protein  36.54 
 
 		 705 aa  350  5e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0837428  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0428  SctV  36.39 
 
 		 705 aa  350  6e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0489675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3666  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.13 
 
 		 744 aa  350  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.21 
 
 		 694 aa  349  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3906  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.84 
 
 		 709 aa  349  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.316002  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0039  HrcV family type III secretion protein  33.03 
 
 		 694 aa  347  5e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.78 
 
 		 681 aa  347  6e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.34 
 
 		 690 aa  346  7e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.21 
 
 		 692 aa  346  8e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.29 
 
 		 695 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1828  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.71 
 
 		 710 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.560177  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.47 
 
 		 705 aa  343  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0539  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.87 
 
 		 720 aa  343  7e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3819  secretion system apparatus protein SsaV  34.59 
 
 		 682 aa  343  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3907  secretion system apparatus protein SsaV  34.59 
 
 		 682 aa  343  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.72 
 
 		 696 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 692 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.19 
 
 		 706 aa  342  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1402  type III secretion protein HrcV  33.07 
 
 		 695 aa  342  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.29 
 
 		 695 aa  342  2e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2273  secretion system apparatus protein SsaV  34.83 
 
 		 685 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660875  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31020  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.48 
 
 		 686 aa  340  8e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.4 
 
 		 709 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6527  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.39 
 
 		 682 aa  339  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.63 
 
 		 698 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2007  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.91 
 
 		 687 aa  338  1.9999999999999998e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.877962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.28 
 
 		 690 aa  337  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  37.41 
 
 		 694 aa  337  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1969  secretion system apparatus protein SsaV  35.27 
 
 		 685 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.21 
 
 		 700 aa  336  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  33 
 
 		 699 aa  335  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.25 
 
 		 748 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5577  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.29 
 
 		 715 aa  335  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.94 
 
 		 707 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3739  type III secretion FHIPEP protein  41.42 
 
 		 729 aa  335  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728241 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.18 
 
 		 694 aa  334  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.72 
 
 		 693 aa  334  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.98 
 
 		 708 aa  334  3e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.33 
 
 		 694 aa  333  5e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3510  type III secretion FHIPEP  40.58 
 
 		 739 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5428  type III secretion FHIPEP protein  40.58 
 
 		 738 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.158228 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4856  type III secretion FHIPEP protein  40.58 
 
 		 739 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.852382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.05 
 
 		 724 aa  333  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3440  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.85 
 
 		 709 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3367  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.15 
 
 		 745 aa  333  8e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3588  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.19 
 
 		 696 aa  333  8e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.591822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.03 
 
 		 694 aa  333  8e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1560  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.36 
 
 		 709 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.94 
 
 		 707 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.43 
 
 		 697 aa  331  2e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.57 
 
 		 693 aa  332  2e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.25 
 
 		 709 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1976  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.55 
 
 		 709 aa  331  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0869734  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0376  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.28 
 
 		 687 aa  331  3e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.86 
 
 		 699 aa  331  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1471  flagellar biosynthesis protein FlhA  36.44 
 
 		 691 aa  330  5.0000000000000004e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551233  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03403  HrcV  40.3 
 
 		 628 aa  330  6e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4753  type III secretion FHIPEP protein  41.26 
 
 		 734 aa  330  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.936418 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  35.18 
 
 		 692 aa  330  7e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.52 
 
 		 700 aa  330  7e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0119  type III secretion FHIPEP  33.48 
 
 		 691 aa  330  8e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717774  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.85 
 
 		 699 aa  329  9e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0830  type III secretion system protein BsaQ  35.39 
 
 		 702 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00148926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  34.64 
 
 		 697 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  32.52 
 
 		 710 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  33.62 
 
 		 690 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0181  MxiA  32.6 
 
 		 686 aa  328  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.317085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>