More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2007 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2007  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
687 aa  1347    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.877962  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2315  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.94 
 
 
680 aa  729    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0546949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31020  flagellar biosynthesis protein FlhA  72.2 
 
 
686 aa  972    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.5 
 
 
702 aa  766    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0472472  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2972  flagellar biosynthesis protein FlhA  63.94 
 
 
682 aa  845    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0958  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.23 
 
 
680 aa  733    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0861  flagellar biosynthesis protein FlhA  54.88 
 
 
708 aa  704    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.186117  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0739  flagellar biosynthesis protein FlhA  56.18 
 
 
681 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0070  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.1 
 
 
692 aa  578  1e-164  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.42428  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2392  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.68 
 
 
690 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0790  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.31 
 
 
690 aa  548  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000500888  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0159  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.47 
 
 
676 aa  547  1e-154  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.533108  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1413  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.13 
 
 
686 aa  544  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.176354  normal  0.558149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3767  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.91 
 
 
692 aa  525  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3851  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.24 
 
 
692 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000167765 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4111  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.34 
 
 
694 aa  521  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0120784  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0761  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.57 
 
 
696 aa  519  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417775  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1315  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.64 
 
 
697 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0869  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.06 
 
 
686 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3444  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.15 
 
 
695 aa  513  1e-144  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16680  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.66 
 
 
689 aa  509  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0485  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.73 
 
 
676 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3056  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.94 
 
 
696 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1748  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.31 
 
 
692 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4134  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.14 
 
 
688 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000385225  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1673  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.79 
 
 
673 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.5 
 
 
678 aa  505  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000195555  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1162  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.66 
 
 
694 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.86 
 
 
697 aa  503  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0588  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.3 
 
 
695 aa  504  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0019  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.5 
 
 
678 aa  504  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000147503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3040  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.43 
 
 
708 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2031  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.88 
 
 
674 aa  499  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.57 
 
 
703 aa  499  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1130  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.4 
 
 
679 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2029  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.82 
 
 
684 aa  496  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2179  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.7 
 
 
711 aa  492  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.628816  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.86 
 
 
700 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0426  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.13 
 
 
694 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.36 
 
 
702 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.57 
 
 
699 aa  492  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.7 
 
 
700 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1410  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.92 
 
 
682 aa  494  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.92 
 
 
693 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.12 
 
 
697 aa  491  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.23 
 
 
708 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.44 
 
 
706 aa  492  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.23 
 
 
708 aa  491  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3286  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.46 
 
 
696 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.3 
 
 
692 aa  485  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2153  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.57 
 
 
678 aa  486  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0681  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.67 
 
 
710 aa  487  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.84682 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.79 
 
 
700 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  40.88 
 
 
696 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.79 
 
 
700 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.79 
 
 
700 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.21 
 
 
699 aa  483  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.79 
 
 
700 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.79 
 
 
700 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.74 
 
 
700 aa  484  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.28 
 
 
693 aa  485  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0704  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.27 
 
 
688 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3129  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.79 
 
 
700 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.79 
 
 
700 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.65 
 
 
710 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.36 
 
 
699 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.41 
 
 
694 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2963  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.29 
 
 
700 aa  481  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.107248  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.1 
 
 
699 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.79 
 
 
700 aa  481  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.36 
 
 
690 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.24 
 
 
700 aa  481  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.18 
 
 
693 aa  482  1e-134  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.41 
 
 
694 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.79 
 
 
693 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0405  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.42 
 
 
712 aa  479  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245167  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.5 
 
 
698 aa  477  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3471  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.04 
 
 
695 aa  477  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2022  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.1 
 
 
681 aa  476  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.71 
 
 
707 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.21 
 
 
699 aa  475  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.39 
 
 
714 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.619596  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  41.49 
 
 
694 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.58 
 
 
695 aa  474  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  39.35 
 
 
698 aa  473  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.56 
 
 
707 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.12 
 
 
705 aa  475  1e-132  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.12 
 
 
692 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2808  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.45 
 
 
715 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18652  normal  0.0746951 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.77 
 
 
700 aa  471  1.0000000000000001e-131  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.77 
 
 
709 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.34 
 
 
690 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.84 
 
 
699 aa  469  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1398  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.86 
 
 
710 aa  471  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.59 
 
 
699 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.72 
 
 
699 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.74 
 
 
699 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  41.59 
 
 
697 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.74 
 
 
699 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0156  flagellar biosynthesis protein FlhA  40.43 
 
 
703 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.391831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>