More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1625 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1625  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277595 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  89.52 
 
 		 254 aa  377  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1391  TPR repeat-containing protein  72.48 
 
 		 298 aa  321  7e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2079  TPR repeat-containing protein  63.41 
 
 		 251 aa  248  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5998  tetratricopeptide TPR_2  63.41 
 
 		 251 aa  248  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1202  TPR repeat-containing protein  63.55 
 
 		 251 aa  248  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5385  TPR repeat-containing protein  61.29 
 
 		 251 aa  245  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.493574  normal  0.361812 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1940  TPR domain-containing protein  60.89 
 
 		 283 aa  245  4e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2098  TPR repeat-containing protein  62.75 
 
 		 221 aa  245  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.359765  normal  0.445544 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1657  TPR domain-containing protein  63.37 
 
 		 283 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000896789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2682  TPR domain-containing protein  63.37 
 
 		 283 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.168981  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2160  TPR domain-containing protein  63.37 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2597  TPR repeat-containing protein  63.37 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249098  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3155  TPR domain-containing protein  63.37 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1433  TPR domain-containing protein  63.37 
 
 		 240 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.302375  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2546  TPR repeat-containing protein  63.37 
 
 		 240 aa  242  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2114  TPR repeat-containing protein  62.38 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1984  TPR repeat-containing protein  61.88 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.758199  normal  0.548252 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0918  TPR repeat-containing protein  43.12 
 
 		 387 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.470673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3091  TPR repeat-containing protein  47.52 
 
 		 196 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1007  TPR repeat-containing protein  48.19 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.203602  normal  0.0564194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1101  Tetratricopeptide domain protein  48.08 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.157985 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2092  TPR repeat-containing protein  53.39 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1622  TPR repeat-containing protein  53.39 
 
 		 190 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1903  TPR repeat-containing protein  43.92 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1348  tetratricopeptide TPR_2  48.44 
 
 		 344 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2866  tetratricopeptide TPR_2  46.15 
 
 		 215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1166  signal peptide protein  47.59 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.129201  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2894  TPR repeat-containing protein  42.66 
 
 		 188 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0708  TPR repeat-containing protein  43.87 
 
 		 178 aa  125  7e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0499  tetratricopeptide TPR_2  43.97 
 
 		 345 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00865356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2506  TPR repeat-containing protein  41.72 
 
 		 219 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4440  TPR repeat-containing protein  43.66 
 
 		 393 aa  123  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2319  TPR repeat-containing protein  44.83 
 
 		 366 aa  121  8e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.147591  hitchhiker  0.000323914 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1882  hypothetical protein  41.78 
 
 		 373 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1121  TPR repeat-containing protein  46.51 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1084  hypothetical protein  50 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.281284  normal  0.0246651 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2083  TPR repeat-containing protein  39.61 
 
 		 460 aa  104  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551673 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.58 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.878212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0857  TPR repeat-containing protein  35.43 
 
 		 271 aa  96.3  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 625 aa  75.9  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  41.05 
 
 		 878 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  34.62 
 
 		 732 aa  66.6  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  40.22 
 
 		 890 aa  65.1  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  33 
 
 		 820 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40 
 
 		 810 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 649 aa  62  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  34.13 
 
 		 714 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.76 
 
 		 632 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  30 
 
 		 864 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 649 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 649 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 716 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 646 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.95 
 
 		 623 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  28.15 
 
 		 682 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  34.09 
 
 		 743 aa  55.1  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 713 aa  55.1  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33 
 
 		 836 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 927 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1406 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  32.69 
 
 		 3560 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 573 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 448 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  29.82 
 
 		 865 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.33 
 
 		 1007 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  37.5 
 
 		 340 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  37.66 
 
 		 875 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 762 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 3145 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29.41 
 
 		 681 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  33.86 
 
 		 714 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 739 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 4079 aa  53.1  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  31.71 
 
 		 715 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 		 317 aa  53.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 405 aa  53.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 685 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 465 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 1180 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  24.24 
 
 		 369 aa  52.4  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.44 
 
 		 642 aa  52.4  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 3301 aa  52.4  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.26 
 
 		 142 aa  52  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.13 
 
 		 462 aa  52  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 750 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 602 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28.81 
 
 		 1694 aa  52  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 1737 aa  52  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 361 aa  51.6  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 1094 aa  51.6  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  44.93 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>