More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4585 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4585  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 571 aa  1152    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0806  MscS mechanosensitive ion channel  61.05 
 
 		 549 aa  631  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1474  MscS Mechanosensitive ion channel  49.21 
 
 		 559 aa  462  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.793179  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3838  MscS Mechanosensitive ion channel  38.46 
 
 		 563 aa  349  8e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3258  MscS mechanosensitive ion channel  37.01 
 
 		 600 aa  347  2e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0680122  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3888  MscS Mechanosensitive ion channel  37.85 
 
 		 563 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.203429 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1723  mechanosensitive ion channel family protein  36.66 
 
 		 545 aa  339  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242798  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0742  MscS Mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 563 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0771  MscS Mechanosensitive ion channel  35.38 
 
 		 563 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.034825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  33.57 
 
 		 566 aa  302  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3676  MscS Mechanosensitive ion channel  33.75 
 
 		 524 aa  302  1e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2961  MscS Mechanosensitive ion channel  32.7 
 
 		 593 aa  299  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.80043  hitchhiker  0.0000000094968 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2344  MscS Mechanosensitive ion channel  32.57 
 
 		 570 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.809256 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4074  MscS mechanosensitive ion channel  35.34 
 
 		 572 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2427  MscS mechanosensitive ion channel  32.49 
 
 		 550 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2865  MscS Mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 545 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3231  MscS Mechanosensitive ion channel  30.97 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0364  MscS Mechanosensitive ion channel  33.76 
 
 		 538 aa  257  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000549474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0997  MscS Mechanosensitive ion channel  32.37 
 
 		 579 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00010123  normal  0.396482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3012  MscS mechanosensitive ion channel  32.34 
 
 		 545 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1169  MscS Mechanosensitive ion channel  30.58 
 
 		 556 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3049  MscS mechanosensitive ion channel  34.66 
 
 		 542 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.369639  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2741  MscS mechanosensitive ion channel  32.41 
 
 		 545 aa  249  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4449  MscS Mechanosensitive ion channel  32.86 
 
 		 546 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1278  small-conductance mechanosensitive channel-like  36.34 
 
 		 520 aa  242  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4631  MscS mechanosensitive ion channel  35.2 
 
 		 581 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1646  MscS mechanosensitive ion channel  34.04 
 
 		 557 aa  203  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2521  MscS mechanosensitive ion channel  45.58 
 
 		 230 aa  204  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.871653  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1050  MscS mechanosensitive ion channel  31.83 
 
 		 481 aa  192  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1572  MscS Mechanosensitive ion channel  23.94 
 
 		 548 aa  147  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917582 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0897  MscS Mechanosensitive ion channel  23.58 
 
 		 545 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1074  MscS mechanosensitive ion channel  25.31 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0868741  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1734  MscS mechanosensitive ion channel  28.83 
 
 		 358 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  23.47 
 
 		 636 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3399  MscS mechanosensitive ion channel  29.35 
 
 		 345 aa  95.1  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1412  MscS Mechanosensitive ion channel  27.02 
 
 		 550 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00593  MscS Mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 356 aa  93.6  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.863063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  21.31 
 
 		 685 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  30.49 
 
 		 435 aa  92.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2295  mechanosensitive ion channel family protein  24.02 
 
 		 289 aa  90.5  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1632  mechanosensitive ion channel family protein  31.91 
 
 		 782 aa  89.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.274059  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  23.94 
 
 		 1144 aa  88.6  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2229  MscS Mechanosensitive ion channel  30.82 
 
 		 400 aa  88.2  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.224666  normal  0.568068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1062  MscS Mechanosensitive ion channel  27.32 
 
 		 310 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.771269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1862  MscS mechanosensitive ion channel  26.13 
 
 		 867 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  29.78 
 
 		 636 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2332  MscS Mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 362 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  27.96 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2381  MscS mechanosensitive ion channel  26.73 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  0.00000285336 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2000  MscS Mechanosensitive ion channel  31.9 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.03582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  25.17 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2829  MscS mechanosensitive ion channel  25.73 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  27.93 
 
 		 299 aa  80.9  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45100  potassium efflux protein KefA  25.45 
 
 		 1117 aa  80.5  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534635  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1417  MscS Mechanosensitive ion channel  26.36 
 
 		 304 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  32.14 
 
 		 288 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3222  MscS mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 866 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1438  MscS mechanosensitive ion channel  24.88 
 
 		 840 aa  79  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.139296  normal  0.137989 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0553  MscS mechanosensitive ion channel  26.47 
 
 		 874 aa  79.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.362584 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  25.22 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  25.91 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  28.28 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3390  MscS mechanosensitive ion channel  24.66 
 
 		 861 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3862  MscS mechanosensitive ion channel  26.4 
 
 		 830 aa  77.4  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.725538  normal  0.276406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1647  MscS Mechanosensitive ion channel  30.17 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4892  MscS Mechanosensitive ion channel  29.45 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2010  MscS Mechanosensitive ion channel  23.58 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  27.49 
 
 		 1128 aa  77  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0145  MscS Mechanosensitive ion channel  23.72 
 
 		 795 aa  77  0.0000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.584574 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3826  MscS Mechanosensitive ion channel  24.42 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1189  MscS Mechanosensitive ion channel  26.05 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  27.14 
 
 		 288 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  30.9 
 
 		 288 aa  76.6  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1034  MscS mechanosensitive ion channel  32.9 
 
 		 288 aa  75.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1942  MscS mechanosensitive ion channel  24.65 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2035  MscS Mechanosensitive ion channel  23.11 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  24.12 
 
 		 1166 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0559  potassium efflux protein KefA  24.86 
 
 		 1111 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000200237 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  24.8 
 
 		 280 aa  75.9  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1699  MscS mechanosensitive ion channel  27.56 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.254155  normal  0.22429 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2555  MscS mechanosensitive ion channel  30.22 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2105  MscS Mechanosensitive ion channel  22.47 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0600957  normal  0.059013 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  35.23 
 
 		 291 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  37.58 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  24.16 
 
 		 275 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0057  MscS Mechanosensitive ion channel  25.25 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.185804  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2426  MscS mechanosensitive ion channel  29.67 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.610338  hitchhiker  0.0000133571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  33.88 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02489  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  24.36 
 
 		 367 aa  74.7  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2326  MscS mechanosensitive ion channel  25.14 
 
 		 1127 aa  74.3  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1888  MscS Mechanosensitive ion channel  26.37 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3443  MscS mechanosensitive ion channel  23.3 
 
 		 1067 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588  transporter, putative  23.3 
 
 		 1067 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0569  MscS Mechanosensitive ion channel  25.2 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.912877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  30 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1146  MscS mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.779955  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2257  MscS mechanosensitive ion channel  25.13 
 
 		 1110 aa  73.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.371999  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1103 aa  73.6  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0822  MscS mechanosensitive ion channel  26.6 
 
 		 847 aa  73.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0649099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  28.14 
 
 		 274 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>