More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2729 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_2729  major facilitator transporter  100 
 
 		 489 aa  962    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.876432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3530  major facilitator superfamily MFS_1  86.68 
 
 		 491 aa  789    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0831333  normal  0.224408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0428  major facilitator superfamily sugar transporter  86.89 
 
 		 491 aa  793    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  69.92 
 
 		 483 aa  633  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  69.3 
 
 		 480 aa  633  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  71.13 
 
 		 483 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  69.43 
 
 		 488 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  68.08 
 
 		 476 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  67.44 
 
 		 481 aa  613  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  65.64 
 
 		 494 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  64.68 
 
 		 504 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  70.75 
 
 		 597 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  66.26 
 
 		 493 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  64.11 
 
 		 495 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  68.15 
 
 		 484 aa  596  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  64.97 
 
 		 493 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  64.71 
 
 		 490 aa  579  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  63.19 
 
 		 492 aa  558  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4791  major facilitator superfamily MFS_1  64.47 
 
 		 492 aa  558  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263491  normal  0.581697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  63.19 
 
 		 492 aa  558  1e-157  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  65.68 
 
 		 472 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  60.3 
 
 		 474 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  53.21 
 
 		 483 aa  479  1e-134  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  51.75 
 
 		 491 aa  473  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  56.24 
 
 		 483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  50.94 
 
 		 493 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  50.51 
 
 		 495 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  54.41 
 
 		 501 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  54.13 
 
 		 514 aa  438  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  54.04 
 
 		 497 aa  426  1e-118  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  54.07 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  51.45 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  49.79 
 
 		 483 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  51.05 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  48.73 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 481 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  33.19 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 465 aa  172  2e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 447 aa  150  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  29.39 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 459 aa  139  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  32.04 
 
 		 438 aa  134  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 435 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  24.79 
 
 		 460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 479 aa  127  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 456 aa  126  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 479 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 479 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 479 aa  124  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 485 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.69 
 
 		 449 aa  124  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 471 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 445 aa  120  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2181  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 470 aa  119  9e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000990983  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 487 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.31 
 
 		 455 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 427 aa  119  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  34.88 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.93 
 
 		 450 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  29.57 
 
 		 461 aa  117  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  37.27 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  29.3 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.23 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  28.5 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 480 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 480 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  32 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 399 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 461 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 399 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  27.01 
 
 		 450 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5167  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 470 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  28.21 
 
 		 399 aa  113  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 465 aa  113  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  32.25 
 
 		 465 aa  113  9e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  27.75 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  27.98 
 
 		 399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  30.44 
 
 		 465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.16 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 469 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  25.8 
 
 		 438 aa  110  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>