More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1578 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1578  Rhs family protein  100 
 
 		 1556 aa  3235    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.883586  normal  0.184607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  26.1 
 
 		 1576 aa  222  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  26.03 
 
 		 1611 aa  218  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  25.72 
 
 		 1572 aa  207  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1411 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  24.2 
 
 		 1386 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1409 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  26.29 
 
 		 1586 aa  199  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003490  Rhs family protein  23.61 
 
 		 1384 aa  197  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  25.85 
 
 		 1595 aa  196  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.14 
 
 		 1489 aa  197  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  26.31 
 
 		 1518 aa  196  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  24.95 
 
 		 1520 aa  193  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1551 aa  190  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  26.67 
 
 		 1614 aa  189  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  23.71 
 
 		 1400 aa  188  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  25.53 
 
 		 1527 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1586 aa  184  8.000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  25.02 
 
 		 1531 aa  185  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  26.08 
 
 		 1485 aa  184  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1550 aa  183  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6418  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1368 aa  182  5.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0100911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  23.03 
 
 		 1560 aa  181  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  24.14 
 
 		 1385 aa  180  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  24.24 
 
 		 1528 aa  179  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1410 aa  178  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1504  YD repeat protein  24.08 
 
 		 1457 aa  178  8e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  24.68 
 
 		 1446 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  26.15 
 
 		 1362 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  23.78 
 
 		 1422 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  24.72 
 
 		 1981 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0420  YD repeat protein  24.16 
 
 		 1475 aa  174  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  24.38 
 
 		 1429 aa  174  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  24.68 
 
 		 1509 aa  174  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  24.09 
 
 		 1547 aa  174  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1160  YD repeat protein  24.31 
 
 		 1423 aa  172  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00301652  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  25 
 
 		 1568 aa  172  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  23.81 
 
 		 1197 aa  172  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  25.81 
 
 		 867 aa  171  7e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  25.84 
 
 		 1495 aa  172  7e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  24.94 
 
 		 924 aa  171  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1554 aa  171  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2694  YD repeat protein  23.99 
 
 		 1428 aa  171  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00194911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.18 
 
 		 1508 aa  171  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1487 aa  170  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  25.63 
 
 		 1348 aa  170  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  25.55 
 
 		 866 aa  166  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  25.42 
 
 		 1259 aa  165  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  22.78 
 
 		 1434 aa  165  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0051  YD repeat protein  23.26 
 
 		 1437 aa  164  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  25.09 
 
 		 1494 aa  162  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  25.09 
 
 		 1494 aa  162  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  24.53 
 
 		 1421 aa  160  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4580  YD repeat protein  22.18 
 
 		 1401 aa  160  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  23.34 
 
 		 1539 aa  158  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  23.2 
 
 		 1447 aa  158  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  23.34 
 
 		 1543 aa  157  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.3 
 
 		 1552 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  24.43 
 
 		 2096 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  23.61 
 
 		 1573 aa  155  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  24.97 
 
 		 1488 aa  153  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  26.19 
 
 		 2277 aa  152  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0346  YD repeat-containing protein  24.39 
 
 		 2035 aa  152  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  24.43 
 
 		 1495 aa  152  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  23.91 
 
 		 1602 aa  152  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  24.49 
 
 		 1359 aa  151  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8624  YD repeat protein  25.14 
 
 		 1528 aa  151  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.165231  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2568  YD repeat protein  25.33 
 
 		 931 aa  151  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0084  YD repeat-containing protein  25.03 
 
 		 1352 aa  149  5e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  23.87 
 
 		 1679 aa  149  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  25.33 
 
 		 1579 aa  147  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  23.93 
 
 		 1492 aa  148  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  24.5 
 
 		 1541 aa  147  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1541 aa  147  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.87 
 
 		 1466 aa  147  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  25.33 
 
 		 1428 aa  146  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  23.38 
 
 		 1673 aa  146  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0585  YD repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1600 aa  146  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  24.7 
 
 		 3027 aa  146  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  22.64 
 
 		 1229 aa  145  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1541 aa  145  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1541 aa  145  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1541 aa  145  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1541 aa  145  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3079  YD repeat-containing protein  24 
 
 		 1505 aa  145  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  23.21 
 
 		 1609 aa  145  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  24.43 
 
 		 1381 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  24.68 
 
 		 1593 aa  142  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  24.63 
 
 		 1530 aa  141  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  23.18 
 
 		 1639 aa  141  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0647  RHS Repeat family protein  24.18 
 
 		 1616 aa  138  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  31.83 
 
 		 451 aa  139  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  24.81 
 
 		 1517 aa  138  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1472  YD repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1600 aa  138  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.059879  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  23.45 
 
 		 1418 aa  138  9e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1565 aa  137  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  25.05 
 
 		 1565 aa  137  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24 
 
 		 1527 aa  135  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  24.17 
 
 		 1417 aa  134  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2808  peptidase C39, bacteriocin processing  24.92 
 
 		 1599 aa  132  6e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>