More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3051 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_05170  fumarate hydratase  71.46 
 
 		 473 aa  646    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.164767  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4397  fumarate lyase  71.77 
 
 		 473 aa  646    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1112  fumarate hydratase  72.77 
 
 		 471 aa  661    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.364748  normal  0.37328 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0935  fumarate lyase  73.59 
 
 		 476 aa  656    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1000  fumarate lyase  69.35 
 
 		 472 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0742  fumarate lyase  72.11 
 
 		 471 aa  679    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.299304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0459  fumarate hydratase  69.8 
 
 		 463 aa  659    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907865  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0839  fumarate lyase  69.4 
 
 		 464 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8511  fumarate lyase  72.27 
 
 		 463 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1252  fumarate hydratase  71.86 
 
 		 475 aa  657    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000132055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3051  fumarate hydratase  100 
 
 		 465 aa  939    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0959329 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26470  fumarase  75.05 
 
 		 473 aa  695    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288961  normal  0.266407 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1181  fumarate hydratase  70.66 
 
 		 473 aa  663    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0978072  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0959  fumarate lyase  74.4 
 
 		 473 aa  647    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  hitchhiker  0.000463461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0107  fumarate lyase  69.65 
 
 		 462 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23010  fumarase  70.61 
 
 		 468 aa  631  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3085  fumarate lyase  68.12 
 
 		 464 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.743068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1879  fumarate hydratase  70.74 
 
 		 472 aa  630  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1059  fumarate hydratase  69.48 
 
 		 465 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0844  fumarate hydratase  69.91 
 
 		 463 aa  618  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.921062 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3882  fumarate hydratase  69.26 
 
 		 463 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.475519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4243  fumarate hydratase  68.35 
 
 		 466 aa  608  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0560645 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4674  fumarate hydratase  67.61 
 
 		 466 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780743  normal  0.186713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1078  fumarate lyase  68.76 
 
 		 464 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31540  fumarate hydratase  66.38 
 
 		 465 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.404053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4649  fumarate hydratase  61.74 
 
 		 471 aa  551  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2065  fumarate hydratase  60.91 
 
 		 469 aa  548  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0865781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1669  fumarate lyase  61.69 
 
 		 466 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4353  fumarate hydratase  63.24 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.121763  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0720  fumarate hydratase  64.92 
 
 		 464 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4122  fumarate hydratase  63.02 
 
 		 473 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264623  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4197  fumarate hydratase  63.02 
 
 		 473 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309456  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11119  fumarate hydratase  61.74 
 
 		 474 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.954044 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07330  fumarase  63.16 
 
 		 463 aa  537  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.24875 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3120  fumarate lyase  61.44 
 
 		 472 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.000941956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0748  fumarate lyase  55.6 
 
 		 467 aa  503  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00385959  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1848  fumarate lyase  59.52 
 
 		 456 aa  498  1e-140  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1786  fumarate lyase  62.3 
 
 		 463 aa  497  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.263641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1359  fumarase  57.73 
 
 		 462 aa  497  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0422  fumarate lyase  53.5 
 
 		 472 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2660  fumarate hydratase  53.25 
 
 		 475 aa  488  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2205  fumarate hydratase  54.33 
 
 		 469 aa  489  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3595  fumarate lyase  52.69 
 
 		 480 aa  490  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.164786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2778  fumarate hydratase  52.68 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.272994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0025  fumarate lyase  56.39 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1812  fumarate lyase  52.47 
 
 		 469 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0807  fumarate hydratase  55.25 
 
 		 469 aa  475  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 461 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2866  fumarate hydratase  56.52 
 
 		 463 aa  475  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  52.27 
 
 		 461 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0893  fumarate hydratase  53.12 
 
 		 469 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1543  fumarate hydratase  55.97 
 
 		 469 aa  471  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  52.92 
 
 		 461 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5854  fumarate lyase  55.94 
 
 		 440 aa  472  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  52.34 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2102  fumarate hydratase  55.43 
 
 		 459 aa  473  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.306021  normal  0.0112953 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0324  fumarate hydratase  53.78 
 
 		 468 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.86166e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01214  fumarate hydratase  56.07 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2626  fumarate hydratase  54.25 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0946785  normal  0.393755 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  52.16 
 
 		 463 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  53.64 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0633  fumarate lyase  52.71 
 
 		 469 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.644026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  52.56 
 
 		 468 aa  458  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  53.79 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  53.79 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  50.65 
 
 		 463 aa  456  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  53.17 
 
 		 462 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1650  fumarate hydratase  54.25 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  52.7 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  51.39 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  50.88 
 
 		 464 aa  446  1.0000000000000001e-124  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  51.62 
 
 		 464 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1992  fumarate hydratase  51.94 
 
 		 460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.768231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  51.4 
 
 		 464 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  51.4 
 
 		 464 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  51.4 
 
 		 464 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  51.62 
 
 		 631 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  51.19 
 
 		 464 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1901  fumarate hydratase  50.87 
 
 		 470 aa  445  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.687119  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  51.4 
 
 		 464 aa  445  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36139  fumarate hydratase  50.44 
 
 		 462 aa  443  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09838  FumC  52.11 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  51.4 
 
 		 464 aa  445  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  48.26 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1189  fumarate hydratase, class II  50.32 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0984  fumarate hydratase  53.45 
 
 		 459 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0944  fumarate hydratase  53.23 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  48.04 
 
 		 459 aa  441  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1384  fumarate hydratase  50.76 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1975  fumarate hydratase  51.33 
 
 		 462 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00792207  normal  0.442313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2108  fumarate hydratase  53.56 
 
 		 459 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.866969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5084  fumarate hydratase  53.55 
 
 		 458 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209589  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  49.79 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  49.68 
 
 		 466 aa  438  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4461  fumarate hydratase, class II  54.55 
 
 		 458 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1441  fumarate lyase  52.67 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  50.43 
 
 		 464 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58030  fumarate hydratase  52.69 
 
 		 458 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.127723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1177  fumarate hydratase  53.02 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.661179  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1038  fumarate hydratase  50.97 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.88915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>