More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2480 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 221 aa  423  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  45.14 
 
 		 218 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 259 aa  75.1  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 246 aa  75.1  0.0000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  41.61 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  34.03 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  56.14 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  30.8 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  36.77 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  35.9 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 250 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1495  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.969103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  33.33 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  59.18 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  32.88 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  31.97 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 240 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  32.13 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  28.95 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 311 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 173 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  33.75 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  45 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 281 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1491  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 232 aa  52.8  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.784951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 257 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 267 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>