230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3517 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3517  trancscriptional regulator MtrR, putative  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178393  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 196 aa  111  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 195 aa  91.7  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  26.63 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4377  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1083  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.243709  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0918  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.141078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1642  regulatory protein TetR  25.75 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.906249  normal  0.298485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1588  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 243 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.556176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1924  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.436993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  20.92 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  24.53 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2160  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.308493 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1122  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0273535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3141  TetR family transcriptional regulator  22.02 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  26.25 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  20.54 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  22.01 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1755  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  22.01 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 181 aa  48.1  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  22.01 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  40.62 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3705  regulatory protein TetR  27.61 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  28.37 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  22.15 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.37 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.37 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.37 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.37 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  28.37 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 261 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  19.21 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  21.38 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 232 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>