More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2961 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_2961  hypothetical protein  100 
 
 
561 aa  1112    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.638324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0541  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  48.32 
 
 
687 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0534  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  47.47 
 
 
733 aa  283  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.627871  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0533  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  47.24 
 
 
712 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.566253  normal  0.595703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5325  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.14 
 
 
556 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.473909  normal  0.0899605 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.19 
 
 
573 aa  253  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.58 
 
 
563 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.7 
 
 
563 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.25 
 
 
694 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.16 
 
 
563 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 
675 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.4 
 
 
561 aa  243  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
561 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.31 
 
 
567 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.25 
 
 
689 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  42.21 
 
 
688 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.02 
 
 
689 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  39.86 
 
 
561 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  40.63 
 
 
566 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36 
 
 
562 aa  239  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.74 
 
 
586 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.78 
 
 
561 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  41.29 
 
 
563 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.96 
 
 
670 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.58 
 
 
563 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.95 
 
 
561 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  40.05 
 
 
691 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.8 
 
 
560 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 
691 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.12 
 
 
655 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.84 
 
 
566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 
688 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  40.98 
 
 
656 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.77 
 
 
566 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  41.13 
 
 
688 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.58 
 
 
563 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  40.89 
 
 
568 aa  233  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.41 
 
 
686 aa  233  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  40.22 
 
 
656 aa  233  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.27 
 
 
688 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  41.67 
 
 
691 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  41.97 
 
 
602 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.69 
 
 
681 aa  230  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.77 
 
 
562 aa  230  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00511002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.88 
 
 
656 aa  230  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.66 
 
 
561 aa  230  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0575  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.26 
 
 
681 aa  230  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0336  chemotaxis sensory transducer  40.75 
 
 
563 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.24 
 
 
563 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.04 
 
 
567 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3379  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.17 
 
 
587 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.787169  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7508  putative methyl-accepting chemotaxis protein (with a HAMP region)  42.02 
 
 
552 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.692825  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  37.47 
 
 
565 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  40.72 
 
 
563 aa  226  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 
567 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 
563 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.98 
 
 
673 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.38 
 
 
741 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.65 
 
 
672 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3377  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.49 
 
 
563 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.528008  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  38.81 
 
 
712 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  39.02 
 
 
688 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.25 
 
 
711 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.95 
 
 
656 aa  225  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 
712 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  39.84 
 
 
565 aa  224  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  32.51 
 
 
561 aa  223  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.14 
 
 
563 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.23 
 
 
667 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2903  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.47 
 
 
568 aa  223  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.335645  normal  0.0996392 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.38 
 
 
563 aa  223  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  38.13 
 
 
676 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  39.33 
 
 
674 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.54 
 
 
562 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.62 
 
 
564 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.301128  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.86 
 
 
561 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  38.17 
 
 
566 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.54 
 
 
563 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.32606  normal  0.0943242 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.81 
 
 
561 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 
563 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  37.43 
 
 
561 aa  220  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.73 
 
 
561 aa  220  6e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  38.92 
 
 
565 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.69 
 
 
560 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1867  chemotaxis sensory transducer  37.79 
 
 
714 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.133032 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.97 
 
 
674 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 
562 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  38.93 
 
 
697 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  39.11 
 
 
577 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3424  chemotaxis sensory transducer  40.27 
 
 
558 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.574813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2546  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 
649 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.389712  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.74 
 
 
649 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.66 
 
 
562 aa  217  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3907  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.68 
 
 
565 aa  217  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.38 
 
 
572 aa  217  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.27 
 
 
558 aa  217  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.81 
 
 
561 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 
608 aa  216  8e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2906  putative methyl-accepting chemotaxis protein  41.49 
 
 
564 aa  216  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.106702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 
651 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.064764  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>