More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0644 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0644  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  100 
 
 
565 aa  1127    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4464  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.62 
 
 
573 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.610641  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.4 
 
 
563 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.25 
 
 
567 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4941  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.67 
 
 
563 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1253  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.49 
 
 
567 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.010155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.71 
 
 
579 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0132835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3904  chemotaxis sensory transducer  39.68 
 
 
566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0158  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.53 
 
 
561 aa  337  5e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  40.14 
 
 
559 aa  335  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4787  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.3 
 
 
561 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4104  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.6 
 
 
586 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.783692  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 
560 aa  333  6e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.14669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1048  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.6 
 
 
559 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1316  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 
561 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4105  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.82 
 
 
561 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.916882  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1840  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.32 
 
 
561 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.745103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2846  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41 
 
 
565 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.430745  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  45.37 
 
 
688 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.11 
 
 
562 aa  322  9.999999999999999e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  48.23 
 
 
565 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6635  methyl-accepting chemotaxis protein  48.93 
 
 
565 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.459746  normal  0.104137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0820  chemotaxis sensory transducer  38.8 
 
 
608 aa  320  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254614  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2025  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.36 
 
 
688 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0110809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.59 
 
 
566 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1918  chemotaxis sensory transducer  49.18 
 
 
688 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.537222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.14 
 
 
566 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3545  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.1 
 
 
689 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.457552  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
561 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432423  normal  0.0230577 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3547  chemotaxis sensory transducer  46.92 
 
 
566 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 
575 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  39.12 
 
 
558 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0546434  normal  0.151916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3804  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.18 
 
 
655 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.772812  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2744  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.5 
 
 
572 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696609  normal  0.585687 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5119  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.62 
 
 
563 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.6 
 
 
558 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.532986  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4788  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 
561 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.1 
 
 
560 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.79 
 
 
561 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.97 
 
 
567 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2465  chemotaxis sensory transducer  47.49 
 
 
561 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.5909  normal  0.697276 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0192  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.59 
 
 
688 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
561 aa  301  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.6 
 
 
567 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3147  chemotaxis sensory transducer  50.14 
 
 
561 aa  300  4e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0908078  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0497  chemotaxis sensory transducer  47.18 
 
 
577 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2905  putative methyl-accepting chemotaxis protein  45.32 
 
 
542 aa  297  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.234112  normal  0.211145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.35 
 
 
563 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.44 
 
 
675 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  49.18 
 
 
563 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1388  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.38 
 
 
656 aa  297  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0527529  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  44.35 
 
 
691 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0330  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  45.05 
 
 
676 aa  294  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.7 
 
 
562 aa  294  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.743011  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1427  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.99 
 
 
562 aa  293  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309452  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.61 
 
 
563 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.38 
 
 
563 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
670 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2368  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer precursor  47.75 
 
 
561 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1266  chemotaxis sensory transducer  47.3 
 
 
562 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 
561 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.7 
 
 
672 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  47.11 
 
 
656 aa  290  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4101  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.71 
 
 
698 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 
567 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0981346  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1583  chemotaxis sensory transducer  36.17 
 
 
583 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.105257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  46.72 
 
 
656 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  43.84 
 
 
561 aa  286  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  47.58 
 
 
712 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  48.15 
 
 
716 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2901  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.47 
 
 
674 aa  286  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14772  normal  0.22504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  46.98 
 
 
561 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.73 
 
 
673 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.97 
 
 
560 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.94 
 
 
566 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3409  chemotaxis sensory transducer  49.29 
 
 
651 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.304746  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3107  chemotaxis sensory transducer  44.68 
 
 
674 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0664997 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2904  putative methyl-accepting chemotaxis protein  46.13 
 
 
568 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481458  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0581  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.77 
 
 
562 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0281709  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.87 
 
 
694 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1408  chemotaxis sensory transducer  46.81 
 
 
568 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.591131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 
731 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2078  chemotaxis sensory transducer  47.71 
 
 
561 aa  282  9e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.960991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4527  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.33 
 
 
667 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.527831 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2996  methyl-accepting chemotaxis protein  46.2 
 
 
698 aa  281  2e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1584  chemotaxis sensory transducer  36.03 
 
 
556 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  47.81 
 
 
691 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.05 
 
 
563 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 
563 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2738  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.5 
 
 
562 aa  280  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.809654  normal  0.020868 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1977  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.32 
 
 
651 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.064764  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.17 
 
 
689 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.497103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.83 
 
 
558 aa  280  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.152196  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5144  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.63 
 
 
686 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.77 
 
 
711 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3378  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.49 
 
 
563 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104618  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3344  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.99 
 
 
561 aa  280  6e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.828703  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.37 
 
 
698 aa  280  7e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0139762  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
568 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.55655  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0153  chemotaxis sensory transducer  47.3 
 
 
602 aa  280  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>