89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3336 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  59.21 
 
 		 532 aa  646    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 537 aa  1081    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  42.99 
 
 		 561 aa  423  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  39.89 
 
 		 557 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.84 
 
 		 552 aa  397  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  37.38 
 
 		 544 aa  367  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  37.25 
 
 		 552 aa  361  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  35.65 
 
 		 548 aa  326  5e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  35.66 
 
 		 564 aa  313  6.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  32.9 
 
 		 565 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  33.21 
 
 		 560 aa  280  3e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4938  ABC-type sugar transport system periplasmic component  31.89 
 
 		 558 aa  266  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000971011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  30.51 
 
 		 563 aa  216  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 		 547 aa  202  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  29.7 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  27.31 
 
 		 552 aa  176  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.14 
 
 		 544 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  29.17 
 
 		 568 aa  146  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.58 
 
 		 547 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 561 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  27.54 
 
 		 567 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 510 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  20.83 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5698  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.145305  normal  0.141272 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 415 aa  67.4  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  21.84 
 
 		 523 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.03 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 425 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  21.41 
 
 		 414 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 424 aa  54.3  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.26 
 
 		 437 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.26 
 
 		 437 aa  54.3  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 437 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  22.1 
 
 		 537 aa  53.5  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 		 522 aa  53.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 440 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 417 aa  52  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 556 aa  50.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 427 aa  50.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  22.66 
 
 		 419 aa  50.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  28.57 
 
 		 408 aa  50.4  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 557 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  20.74 
 
 		 553 aa  49.3  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0306  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0631  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 		 435 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  30.43 
 
 		 426 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  19.42 
 
 		 571 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0845  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 		 435 aa  48.9  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 418 aa  47.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 429 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 436 aa  47.8  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 425 aa  47.8  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 412 aa  47.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 424 aa  47  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 430 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.52 
 
 		 544 aa  46.6  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.11 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 415 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 420 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.83 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  21.94 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16190  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  19.03 
 
 		 567 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 424 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3270  extracellular solute-binding protein family 1  30.3 
 
 		 435 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.543416  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 420 aa  45.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 420 aa  45.1  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 424 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 504 aa  44.3  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 399 aa  44.3  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.09 
 
 		 438 aa  44.3  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 424 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 449 aa  44.3  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  32.32 
 
 		 408 aa  43.9  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  19.57 
 
 		 419 aa  43.9  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 422 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 439 aa  43.5  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.63 
 
 		 453 aa  43.5  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 542 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>