More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3121 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 415 aa  818    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  44.36 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  44.12 
 
 		 412 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  43.5 
 
 		 423 aa  275  8e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  41.43 
 
 		 389 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  41.83 
 
 		 405 aa  255  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  44.31 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  41.12 
 
 		 428 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2934  protein serine/threonine phosphatase  39.64 
 
 		 406 aa  239  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3042  protein serine/threonine phosphatase  40.46 
 
 		 492 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0802508  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  38.4 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  35.05 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0436  Stage II sporulation E family protein  39.92 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3860  protein serine/threonine phosphatase  30.96 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4114  protein serine/threonine phosphatase  33.85 
 
 		 426 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  32.66 
 
 		 687 aa  104  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  28.51 
 
 		 684 aa  101  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  30.93 
 
 		 634 aa  98.2  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  31.64 
 
 		 453 aa  97.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  35.32 
 
 		 708 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  30 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  32.66 
 
 		 708 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  29.63 
 
 		 404 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  32.95 
 
 		 1100 aa  94  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  31.89 
 
 		 396 aa  93.6  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 		 519 aa  92.8  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  30.35 
 
 		 1079 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  29.69 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  31.79 
 
 		 649 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  31.17 
 
 		 631 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.96 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  30.12 
 
 		 429 aa  87.4  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  29.3 
 
 		 705 aa  86.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  31.33 
 
 		 418 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.72 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  29.66 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  29.66 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  26.22 
 
 		 682 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  28.46 
 
 		 754 aa  84  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  30.56 
 
 		 644 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  29.77 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  28.35 
 
 		 705 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  30.68 
 
 		 642 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0848  protein serine/threonine phosphatase  32.64 
 
 		 369 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.509752  normal  0.225073 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  29.57 
 
 		 637 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  27.46 
 
 		 536 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  30.8 
 
 		 1087 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  31.76 
 
 		 660 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  31.72 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1690  putative PAS/PAC sensor protein  33.59 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.074722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  30.86 
 
 		 642 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  28.63 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  31.46 
 
 		 1087 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0864  putative PAS/PAC sensor protein  42.65 
 
 		 633 aa  80.5  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2409  Stage II sporulation E family protein  29.43 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0672  RsbU-like serine phosphatase, regulator of sigma subunit  28.86 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  27.2 
 
 		 566 aa  80.1  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  28.63 
 
 		 648 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  25.4 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3720  protein serine/threonine phosphatase  32.24 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  30.8 
 
 		 1083 aa  79.7  0.00000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2345  rsbU-related protein  31.34 
 
 		 249 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  29.67 
 
 		 683 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  27.11 
 
 		 967 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  26.69 
 
 		 445 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  27.11 
 
 		 967 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  30.4 
 
 		 533 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3313  putative PAS/PAC sensor protein  31.29 
 
 		 692 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.7 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.12 
 
 		 961 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  31.76 
 
 		 853 aa  77.4  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  28.03 
 
 		 612 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  31.16 
 
 		 584 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  26.87 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  30.28 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  28.16 
 
 		 678 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.07 
 
 		 1017 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  30.61 
 
 		 716 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  28.63 
 
 		 670 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  28.63 
 
 		 667 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3351  stage II sporulation E family protein  30.24 
 
 		 278 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.33 
 
 		 400 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  24.49 
 
 		 373 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  27.95 
 
 		 705 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  32.57 
 
 		 543 aa  75.5  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  28.81 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.45 
 
 		 563 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  28.83 
 
 		 560 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  26.52 
 
 		 543 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.17 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  30 
 
 		 649 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1833  putative PAS/PAC sensor protein  25.88 
 
 		 560 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  27.97 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  30.07 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  27.69 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>