236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1071 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 331 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00244708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 878 aa  79  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7101  hypothetical protein  38.2 
 
 		 622 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.229846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.02 
 
 		 810 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.25 
 
 		 689 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 739 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.96 
 
 		 887 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 646 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.38 
 
 		 632 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  25.49 
 
 		 682 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 3172 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 649 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 564 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 1486 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  25.93 
 
 		 508 aa  60.5  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 649 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 1450 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  19.65 
 
 		 738 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 4079 aa  58.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2307  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.25 
 
 		 1764 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2681  TPR domain protein  28.21 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 909 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 766 aa  57.4  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.51 
 
 		 764 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.16 
 
 		 1979 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  24.38 
 
 		 676 aa  57.4  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 927 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 366 aa  57  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3547  TPR repeat-containing protein  36.65 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.631542  normal  0.0297483 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 		 715 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 448 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 681 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 		 1276 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.57 
 
 		 725 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  23.63 
 
 		 583 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.39 
 
 		 816 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 762 aa  56.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 767 aa  55.8  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 		 1737 aa  55.8  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 		 566 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  21.95 
 
 		 603 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.59 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 2262 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 792 aa  55.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 486 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.67 
 
 		 730 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 		 1252 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  42.37 
 
 		 1078 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.6 
 
 		 1056 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 		 1252 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.09 
 
 		 818 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 824 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 637 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 828 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  41.67 
 
 		 1079 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 3145 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 505 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4259  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 341 aa  53.1  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.104554 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 543 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.84 
 
 		 1694 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 		 1067 aa  52.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  21.95 
 
 		 436 aa  52.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.61 
 
 		 267 aa  52.8  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3958  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 811 aa  52.8  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0310982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  23.59 
 
 		 265 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.43 
 
 		 561 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 685 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 713 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.43 
 
 		 561 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1753  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.43 
 
 		 623 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 207 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.54 
 
 		 784 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  31.4 
 
 		 2262 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 1406 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  19.8 
 
 		 750 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 652 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  23.56 
 
 		 560 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 3560 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 243 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1188  peptidase S41  25 
 
 		 897 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.130898  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.71 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.64 
 
 		 1013 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.56 
 
 		 576 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24.54 
 
 		 643 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.36 
 
 		 681 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  24.38 
 
 		 865 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.09 
 
 		 626 aa  50.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  25.3 
 
 		 734 aa  50.4  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.09 
 
 		 614 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 280 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  40.62 
 
 		 1078 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>