106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1963 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1963  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 602 aa  1239    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.878392  normal  0.93082 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 878 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.77 
 
 		 810 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.62 
 
 		 1737 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 486 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.15 
 
 		 818 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 566 aa  68.2  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.51 
 
 		 632 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.95 
 
 		 988 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.47 
 
 		 784 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 		 847 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.28 
 
 		 1056 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.97 
 
 		 1022 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.27 
 
 		 2240 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.35 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 767 aa  58.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 594 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  21.78 
 
 		 632 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 718 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.25 
 
 		 887 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.03 
 
 		 1421 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.86 
 
 		 1056 aa  53.9  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  22.77 
 
 		 816 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 685 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 643 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3361  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 750 aa  53.5  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.19 
 
 		 340 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.52 
 
 		 1067 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.56 
 
 		 681 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 		 909 aa  52.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 465 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.64 
 
 		 676 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 790 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.28 
 
 		 364 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 366 aa  51.2  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  29.3 
 
 		 535 aa  51.6  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  25.36 
 
 		 638 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.17 
 
 		 620 aa  50.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  26.71 
 
 		 682 aa  50.8  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  20.99 
 
 		 1486 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.45 
 
 		 267 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  24.85 
 
 		 669 aa  50.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  27.82 
 
 		 1764 aa  49.3  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2076  AAA ATPase central domain protein  42.19 
 
 		 473 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.698999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  23.16 
 
 		 349 aa  48.9  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 3172 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 399 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 		 689 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 637 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.19 
 
 		 3301 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  28.8 
 
 		 395 aa  47.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 		 1406 aa  47.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 563 aa  47.4  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  22.42 
 
 		 374 aa  47.4  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  20.94 
 
 		 681 aa  47.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03378  cellulose synthase subunit  23.39 
 
 		 1157 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  22.86 
 
 		 266 aa  47  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  23.22 
 
 		 362 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 280 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 686 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  22.52 
 
 		 865 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 274 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4018  cellulose synthase subunit BcsC  23.32 
 
 		 1140 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 643 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0187  cellulose synthase subunit BcsC  23.32 
 
 		 1157 aa  47  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.865635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 615 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4895  cellulose synthase subunit BcsC  23.32 
 
 		 1157 aa  47  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03331  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1157 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 		 739 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5809  TPR repeat-containing protein  21.62 
 
 		 546 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.520553 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.1 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 789 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 620 aa  46.2  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.1 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.4 
 
 		 358 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 635 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 635 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 423 aa  45.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 543 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 766 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  22.27 
 
 		 750 aa  45.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.62 
 
 		 385 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  23.83 
 
 		 708 aa  45.1  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 615 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3839  cellulose synthase subunit BcsC  22.88 
 
 		 1157 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.503197 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 645 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.41 
 
 		 917 aa  45.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  22.22 
 
 		 573 aa  44.7  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  27.39 
 
 		 732 aa  44.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  20.44 
 
 		 462 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  23.93 
 
 		 522 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.57 
 
 		 611 aa  44.7  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 744 aa  44.7  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 714 aa  44.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  29.41 
 
 		 604 aa  44.3  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  21.66 
 
 		 361 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1746  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 404 aa  44.3  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 202 aa  44.3  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 1106 aa  44.3  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>