More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3481 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  43.06 
 
 		 1554 aa  909    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  37.49 
 
 		 1602 aa  850    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  94.38 
 
 		 553 aa  1020    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 1586 aa  3229    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  35.32 
 
 		 1362 aa  622  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  34.93 
 
 		 1520 aa  606  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  35 
 
 		 1547 aa  601  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  34.65 
 
 		 1348 aa  598  1e-169  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  35.36 
 
 		 1550 aa  598  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  34.66 
 
 		 1527 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  34.82 
 
 		 1551 aa  592  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  33.28 
 
 		 1560 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  35.49 
 
 		 1446 aa  569  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  33.63 
 
 		 1400 aa  556  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  35.94 
 
 		 1421 aa  553  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  34.39 
 
 		 1411 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  33.36 
 
 		 1385 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  33.68 
 
 		 1981 aa  535  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  34.25 
 
 		 1386 aa  533  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  33.38 
 
 		 1609 aa  533  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  32.92 
 
 		 1573 aa  530  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  33.41 
 
 		 1429 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  33.14 
 
 		 1626 aa  527  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  34.99 
 
 		 1531 aa  522  1e-146  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  31.34 
 
 		 1409 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  31.1 
 
 		 1620 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  34.06 
 
 		 1604 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  30.84 
 
 		 1568 aa  472  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  30.19 
 
 		 1530 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  35.2 
 
 		 1583 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  36.72 
 
 		 866 aa  459  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  31.35 
 
 		 1614 aa  459  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  31.86 
 
 		 1410 aa  456  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  31.76 
 
 		 1229 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  33.82 
 
 		 1654 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1611 aa  442  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  35.49 
 
 		 867 aa  439  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  32.3 
 
 		 1419 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  29.93 
 
 		 1576 aa  422  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  30.59 
 
 		 1418 aa  415  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  31.06 
 
 		 1379 aa  416  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  30.92 
 
 		 1402 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  34.5 
 
 		 924 aa  410  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  30.89 
 
 		 1390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  29.48 
 
 		 1586 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  29.91 
 
 		 1572 aa  396  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08820  Rhs family protein  30.96 
 
 		 1485 aa  394  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0271193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  29.15 
 
 		 1552 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  29.15 
 
 		 1543 aa  393  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  31.1 
 
 		 1595 aa  391  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1422  YD repeat-containing protein  29.16 
 
 		 1197 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.645858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  29.22 
 
 		 1434 aa  379  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32860  Rhs family protein  30.15 
 
 		 1259 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.390343  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  31.09 
 
 		 1140 aa  367  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2951  RhsD protein  28.52 
 
 		 1539 aa  367  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0267  rhsD protein  28.64 
 
 		 1539 aa  365  5.0000000000000005e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  32.68 
 
 		 1319 aa  365  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  31.94 
 
 		 1317 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  29.29 
 
 		 1525 aa  352  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  29.44 
 
 		 1509 aa  350  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  29.36 
 
 		 1508 aa  350  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  29.32 
 
 		 1359 aa  348  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  29.33 
 
 		 1528 aa  344  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2104  rhsD protein  28.21 
 
 		 1593 aa  343  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0967057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00285  RhsD protein  28.84 
 
 		 1428 aa  327  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0673678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8640  YD repeat protein  29.25 
 
 		 1518 aa  325  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.357358  normal  0.924086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05538  RHS Repeat family  29.35 
 
 		 1579 aa  324  7e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0425564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  28.06 
 
 		 1639 aa  323  9.999999999999999e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  26.9 
 
 		 1489 aa  323  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  27.01 
 
 		 1492 aa  319  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  38.69 
 
 		 598 aa  317  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3796  YD repeat-containing protein  57.14 
 
 		 422 aa  315  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.982597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  24.62 
 
 		 1494 aa  315  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  30.1 
 
 		 1410 aa  314  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  28.52 
 
 		 1400 aa  313  1e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  26.82 
 
 		 1495 aa  313  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  28.35 
 
 		 1426 aa  312  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  27.92 
 
 		 1429 aa  312  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  26.57 
 
 		 1466 aa  312  2.9999999999999997e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  28.38 
 
 		 1426 aa  312  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1426 aa  312  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  29.52 
 
 		 1509 aa  310  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  28.95 
 
 		 1268 aa  308  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  28.36 
 
 		 1405 aa  306  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  28.51 
 
 		 1398 aa  306  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1565 aa  301  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  28.8 
 
 		 1565 aa  301  6e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  28.12 
 
 		 1365 aa  299  3e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  28.19 
 
 		 1397 aa  298  6e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  26.83 
 
 		 1528 aa  297  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4544  YD repeat protein  29.52 
 
 		 1488 aa  295  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  30.46 
 
 		 1490 aa  295  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.85 
 
 		 1527 aa  295  6e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  29.45 
 
 		 1417 aa  294  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  27.87 
 
 		 1397 aa  295  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  28.13 
 
 		 1411 aa  294  8e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  28.13 
 
 		 1411 aa  294  8e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  27.87 
 
 		 1411 aa  293  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  27.11 
 
 		 1673 aa  293  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  27.92 
 
 		 1411 aa  293  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>