96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2673 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2673  AsmA family protein  100 
 
 
762 aa  1519    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.583753  normal  0.123003 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1774  AsmA family protein  58.27 
 
 
761 aa  763    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4258  AsmA family protein  53.5 
 
 
791 aa  691    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0521449  normal  0.0888136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2640  AsmA  41.09 
 
 
735 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0817  AsmA  40.1 
 
 
791 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118812  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64510  hypothetical protein  41.73 
 
 
689 aa  439  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4907  hypothetical protein  39.4 
 
 
688 aa  436  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5601  hypothetical protein  41.02 
 
 
689 aa  434  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0791  AsmA family protein  38.79 
 
 
765 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.138985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0721  AsmA family protein  38.83 
 
 
765 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.641564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4261  AsmA family protein  41.44 
 
 
669 aa  429  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.545183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4449  AsmA  39.23 
 
 
688 aa  430  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0566  AsmA  39.2 
 
 
691 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4747  AsmA family protein  35.22 
 
 
678 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4649  AsmA family protein  38.72 
 
 
688 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0580327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4857  AsmA family protein  38.68 
 
 
688 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4735  AsmA family protein  38.72 
 
 
688 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000197359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4914  AsmA family protein  38.38 
 
 
688 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000550525 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4073  hypothetical protein  34.45 
 
 
729 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0571071 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02380  AsmA family protein  40.48 
 
 
677 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0773  hypothetical protein  40.43 
 
 
740 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0128597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3921  AsmA family protein  36.91 
 
 
686 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3727  AsmA family protein  37.42 
 
 
686 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0189  AsmA family protein  37.42 
 
 
691 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03372  predicted outer membrane biogenesis protein  37.42 
 
 
691 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3929  AsmA family protein  37.42 
 
 
686 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3828  AsmA family protein  37.42 
 
 
686 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0975888 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0193  AsmA family protein  37.42 
 
 
691 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4887  AsmA family protein  37.42 
 
 
686 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.647897  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4012  AsmA family protein  37.25 
 
 
686 aa  404  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3882  AsmA family protein  37.27 
 
 
686 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3985  AsmA family protein  37.27 
 
 
686 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.189734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3926  AsmA family protein  37.27 
 
 
686 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3804  AsmA family protein  37.61 
 
 
686 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3817  AsmA family protein  37.1 
 
 
686 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0784  AsmA family protein  38.14 
 
 
680 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1865  AsmA family protein  41.92 
 
 
832 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704419  normal  0.0719659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1703  AsmA family protein  40.65 
 
 
782 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0988  AsmA family protein  40.78 
 
 
810 aa  377  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2321  putative transmembrane protein, AsmA-like  41.49 
 
 
839 aa  372  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.704699 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6307  AsmA  42.37 
 
 
765 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726183  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1797  AsmA family protein  42.37 
 
 
765 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.374116 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1772  AsmA family protein  42.37 
 
 
765 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192484  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1796  AsmA family protein  41.36 
 
 
830 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.147838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0099  AsmA family protein  41.36 
 
 
830 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.483374  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2151  AsmA family protein  41.36 
 
 
830 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2188  AsmA family protein  41.15 
 
 
824 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1067  AsmA family protein  41.36 
 
 
830 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.103538  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1309  AsmA family protein  41.36 
 
 
830 aa  362  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2319  AsmA family protein  41.36 
 
 
830 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1711  AsmA family protein  42.09 
 
 
765 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2268  AsmA family protein  41.29 
 
 
818 aa  357  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.1369  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1683  AsmA family protein  41.63 
 
 
765 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1499  AsmA family protein  41.08 
 
 
759 aa  356  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0473524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5070  uncharacterized protein involved in outer membrane biogenesis, AsmA  40.9 
 
 
764 aa  351  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.207189  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4058  AsmA family protein  39.26 
 
 
745 aa  347  5e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0104  AsmA family protein  39.26 
 
 
739 aa  346  8e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2254  hypothetical protein  35.99 
 
 
632 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.134961  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0079  AsmA  33.8 
 
 
669 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.178612  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1181  AsmA  31.12 
 
 
667 aa  302  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.256758  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3055  AsmA family protein  33.56 
 
 
657 aa  284  3.0000000000000004e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.655109  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0924  AsmA family protein  32.12 
 
 
670 aa  282  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3293  AsmA family protein  31.16 
 
 
656 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.187573  normal  0.760873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0883  AsmA  30.62 
 
 
664 aa  271  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.444148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4106  AsmA family protein  30.33 
 
 
669 aa  265  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850545  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  30.6 
 
 
649 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0666  hypothetical protein  29.12 
 
 
697 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2665  AsmA family protein  28.6 
 
 
674 aa  179  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.100749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2433  AsmA family protein  25.54 
 
 
710 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.2026  normal  0.914727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1200  AsmA  24.65 
 
 
700 aa  148  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0110  AsmA family protein  22.14 
 
 
704 aa  90.9  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1851  AsmA family protein  24.45 
 
 
709 aa  80.5  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.997541 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2657  AsmA  23.49 
 
 
737 aa  79  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.871932  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0489  hypothetical protein  20.13 
 
 
665 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000190696  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01675  AsmA family membrane protein  29.17 
 
 
342 aa  76.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.3424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2769  AsmA family protein  26.62 
 
 
587 aa  70.5  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.961536  normal  0.388317 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2682  AsmA family protein  21.07 
 
 
895 aa  55.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.397979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0552  AsmA family protein  21.89 
 
 
677 aa  54.3  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.259696  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1245  AsmA  28.25 
 
 
643 aa  53.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.350704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1004  AsmA  24.72 
 
 
649 aa  53.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.478001  normal  0.298922 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2863  AsmA family protein  21.46 
 
 
711 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0892  AsmA  25.97 
 
 
655 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  22.56 
 
 
1061 aa  48.9  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  21.54 
 
 
1061 aa  48.5  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0159  AsmA family protein  21.43 
 
 
794 aa  48.5  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1009  hypothetical protein  25.73 
 
 
656 aa  48.1  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5855  AsmA family protein  23.18 
 
 
580 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.734767  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3609  AsmA  22.54 
 
 
640 aa  47.4  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5341  hypothetical protein  26.83 
 
 
741 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2162  AsmA family protein  29.92 
 
 
701 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.152966  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4900  AsmA  26.83 
 
 
741 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002984  AsmA protein  21.45 
 
 
695 aa  44.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2265  hypothetical protein  23.38 
 
 
812 aa  44.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4921  AsmA family protein  22.65 
 
 
747 aa  44.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0711  AsmA family protein  23.65 
 
 
609 aa  44.3  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3033  hypothetical protein  22.55 
 
 
649 aa  44.3  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0689945  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>