69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0732 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 463 aa  899    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  78.62 
 
 		 450 aa  582  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  78.48 
 
 		 450 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  81.64 
 
 		 456 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  83.84 
 
 		 459 aa  556  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  83.04 
 
 		 459 aa  556  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  79.74 
 
 		 460 aa  554  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  82.72 
 
 		 460 aa  541  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  82.51 
 
 		 457 aa  543  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  77.54 
 
 		 450 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  84.35 
 
 		 460 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  79.15 
 
 		 457 aa  536  1e-151  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  82.97 
 
 		 461 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  84.13 
 
 		 464 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  73.32 
 
 		 457 aa  527  1e-148  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  82.29 
 
 		 461 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  82.51 
 
 		 457 aa  516  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  72.71 
 
 		 444 aa  508  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  65.56 
 
 		 387 aa  441  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  61.07 
 
 		 454 aa  352  8e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  51.11 
 
 		 454 aa  349  6e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  63.84 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  66.67 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  48.63 
 
 		 450 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  50 
 
 		 450 aa  334  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  50.33 
 
 		 452 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  49.78 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  49.67 
 
 		 450 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  60.52 
 
 		 420 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  62.91 
 
 		 440 aa  324  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  48.08 
 
 		 448 aa  323  4e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  60.81 
 
 		 387 aa  322  7e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  62.18 
 
 		 439 aa  320  5e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  61.45 
 
 		 449 aa  318  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  47.98 
 
 		 450 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  62.92 
 
 		 431 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  62.18 
 
 		 453 aa  316  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  62.18 
 
 		 453 aa  316  7e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  60.71 
 
 		 390 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  61.73 
 
 		 449 aa  313  5.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  60.73 
 
 		 450 aa  312  6.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  60 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  60.36 
 
 		 407 aa  311  2e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  59.29 
 
 		 401 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  61.94 
 
 		 451 aa  310  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  44.3 
 
 		 468 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  56.61 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  47.77 
 
 		 461 aa  303  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  50.67 
 
 		 407 aa  300  5e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  58.58 
 
 		 457 aa  292  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  56.32 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  56.72 
 
 		 426 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  54.61 
 
 		 449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.42 
 
 		 426 aa  160  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  35.25 
 
 		 437 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  32.14 
 
 		 391 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  28.47 
 
 		 483 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  29.74 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  29.48 
 
 		 409 aa  109  8.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.59 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.36 
 
 		 647 aa  60.5  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  25.59 
 
 		 541 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  24.68 
 
 		 402 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0763  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.91 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  27.33 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4258  hypothetical protein  28.21 
 
 		 633 aa  48.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  24.4 
 
 		 534 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  26.91 
 
 		 493 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5488  conjugal transfer protein TrbL  27.13 
 
 		 382 aa  43.1  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>