More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2193 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2060  WD40 domain-containing protein  62.78 
 
 		 1206 aa  721    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.456517  normal  0.995925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  80.65 
 
 		 1021 aa  1590    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 1077 aa  2097    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  90.41 
 
 		 1078 aa  1806    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5623  WD40 domain protein beta Propeller  32.28 
 
 		 956 aa  406  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2492  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  31.53 
 
 		 970 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0966  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  28.25 
 
 		 976 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000198927  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08230  WD40 domain protein beta Propeller  25.21 
 
 		 918 aa  220  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0325  WD40 domain-containing protein beta Propeller  26.7 
 
 		 901 aa  220  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2423  WD40 domain protein beta Propeller  29.37 
 
 		 881 aa  184  7e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1171  WD40 domain protein beta Propeller  27.15 
 
 		 947 aa  126  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0016  hypothetical protein  20.45 
 
 		 979 aa  90.5  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1741  hypothetical protein  23.42 
 
 		 977 aa  89.7  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  32.79 
 
 		 428 aa  79.7  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  31.13 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1731  translocation protein TolB  40.18 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  39.34 
 
 		 446 aa  77.4  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  41.75 
 
 		 435 aa  76.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  31.47 
 
 		 442 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  34.07 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  34.19 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  34.81 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  26.44 
 
 		 1059 aa  74.7  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  40.78 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  34.07 
 
 		 450 aa  74.7  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.92 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  34.92 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  33.93 
 
 		 442 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  33.93 
 
 		 442 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  37.93 
 
 		 441 aa  74.3  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  33.93 
 
 		 442 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  33.93 
 
 		 442 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 450 aa  74.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  32.17 
 
 		 442 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  31.62 
 
 		 441 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  37.96 
 
 		 440 aa  73.2  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28 
 
 		 442 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  31.62 
 
 		 442 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  31.96 
 
 		 426 aa  73.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  32.56 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  34.19 
 
 		 441 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  32.56 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  32.56 
 
 		 444 aa  73.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  37.96 
 
 		 437 aa  73.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  32.35 
 
 		 450 aa  73.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  34.82 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  35.88 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  38.68 
 
 		 434 aa  72  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  37.5 
 
 		 1005 aa  72  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  37.61 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  30.81 
 
 		 970 aa  71.6  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  31.72 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.45 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  37.11 
 
 		 982 aa  70.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.61 
 
 		 428 aa  71.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  33.04 
 
 		 442 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  35.34 
 
 		 448 aa  70.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 440 aa  70.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  35.83 
 
 		 449 aa  71.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  36.67 
 
 		 432 aa  71.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  39.6 
 
 		 1028 aa  70.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  37.5 
 
 		 441 aa  70.5  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  32.81 
 
 		 509 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  37.61 
 
 		 1014 aa  70.1  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  35.83 
 
 		 449 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  29.27 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  30.15 
 
 		 442 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  37.61 
 
 		 432 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  34.23 
 
 		 567 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.45 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  30.57 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  35.29 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.62 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  33.04 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  33.04 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  33.04 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  36.79 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  27.27 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  36.79 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  36.79 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.45 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.45 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.82 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.61 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  37.1 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  28.78 
 
 		 450 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  34.62 
 
 		 446 aa  67.4  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  34.21 
 
 		 432 aa  67.8  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  39.22 
 
 		 572 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  36.84 
 
 		 424 aa  67.4  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  36.79 
 
 		 434 aa  67  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  32.35 
 
 		 427 aa  67.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  36.63 
 
 		 298 aa  67  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  42.72 
 
 		 428 aa  67.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  38.83 
 
 		 429 aa  67.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  28.94 
 
 		 969 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  35.85 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  36.29 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  36.29 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  28.63 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>