More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01753 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  77.43 
 
 		 545 aa  854    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  100 
 
 		 545 aa  1093    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2130  methyl-accepting chemotaxis protein  51.01 
 
 		 546 aa  497  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665531  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  43.8 
 
 		 712 aa  259  6e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  43.8 
 
 		 712 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  43.38 
 
 		 559 aa  256  6e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 		 638 aa  254  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 543 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 543 aa  251  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 543 aa  250  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 		 497 aa  249  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 543 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.26 
 
 		 674 aa  246  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 		 645 aa  246  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.11 
 
 		 543 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  43.33 
 
 		 713 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 		 568 aa  243  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.36 
 
 		 645 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.55 
 
 		 645 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  44.05 
 
 		 560 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 		 548 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.97 
 
 		 637 aa  242  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 		 645 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.5 
 
 		 552 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 		 554 aa  239  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  42.18 
 
 		 634 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.49 
 
 		 560 aa  239  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.96 
 
 		 643 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  43.03 
 
 		 561 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.03 
 
 		 716 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 		 552 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.47 
 
 		 634 aa  236  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.4 
 
 		 634 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.97 
 
 		 546 aa  236  9e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.44 
 
 		 627 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2814  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.55 
 
 		 702 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.650804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  42.73 
 
 		 561 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.09 
 
 		 564 aa  234  3e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3256  methyl-accepting chemotaxis protein  42.94 
 
 		 558 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.05 
 
 		 544 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.73 
 
 		 637 aa  234  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.63 
 
 		 645 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  42.41 
 
 		 569 aa  233  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26280  putative chemotaxis transducer  34.84 
 
 		 545 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.917899 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  39.71 
 
 		 623 aa  231  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  41.32 
 
 		 622 aa  231  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  39.71 
 
 		 623 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.6 
 
 		 636 aa  228  2e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  44.25 
 
 		 720 aa  228  2e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.09 
 
 		 545 aa  228  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.888266  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.17 
 
 		 640 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  39.06 
 
 		 629 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.37 
 
 		 640 aa  228  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.44 
 
 		 628 aa  228  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 		 638 aa  227  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.39 
 
 		 622 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3864  methyl-accepting chemotaxis protein  42.01 
 
 		 568 aa  226  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.44 
 
 		 628 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  38.24 
 
 		 632 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.56 
 
 		 638 aa  226  8e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.97 
 
 		 636 aa  226  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.27 
 
 		 497 aa  226  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  38.61 
 
 		 643 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.77 
 
 		 541 aa  226  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 		 714 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  39.06 
 
 		 629 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  39.48 
 
 		 714 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0756  methyl-accepting chemotaxis protein  35.58 
 
 		 558 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.71 
 
 		 626 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.03 
 
 		 554 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.48 
 
 		 714 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0938  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 		 548 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  38.7 
 
 		 715 aa  224  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  38.24 
 
 		 632 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  34.98 
 
 		 626 aa  224  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  40.23 
 
 		 641 aa  224  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  39.37 
 
 		 553 aa  224  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.61 
 
 		 632 aa  224  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.24 
 
 		 548 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 		 541 aa  223  6e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.29 
 
 		 548 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 		 638 aa  223  8e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 		 573 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729863  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  39.27 
 
 		 554 aa  223  9e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.06 
 
 		 714 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.7 
 
 		 558 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  39.36 
 
 		 639 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.02 
 
 		 544 aa  221  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.75 
 
 		 554 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07022  histidine kinase  40.23 
 
 		 553 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 		 554 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3532  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.98 
 
 		 555 aa  220  5e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.6 
 
 		 554 aa  220  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  38.62 
 
 		 629 aa  220  6e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 		 541 aa  220  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  39.08 
 
 		 628 aa  220  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01731  Methyl-accepting chemotaxis protein  40.79 
 
 		 539 aa  219  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>