More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0183 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 429 aa  885    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  30.56 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 		 419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  29.48 
 
 		 445 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  31.56 
 
 		 420 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  33.81 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  28.83 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 424 aa  116  8.999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  29.46 
 
 		 416 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  28.53 
 
 		 416 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  26.7 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 		 422 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  30.87 
 
 		 442 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 447 aa  103  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 436 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  31.83 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  33.02 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  28.25 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.39 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 483 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 504 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 436 aa  99.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3128  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 450 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0477771 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 415 aa  98.2  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  33.51 
 
 		 431 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  29.8 
 
 		 444 aa  98.2  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.51 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  30.61 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  26.58 
 
 		 403 aa  96.3  1e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3326  extracellular solute-binding protein  32.56 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  25.89 
 
 		 411 aa  94.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 420 aa  93.6  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0970  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 		 441 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.97 
 
 		 434 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.18 
 
 		 450 aa  90.9  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 456 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  26.97 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3119  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 479 aa  89.7  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 415 aa  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0895  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.441999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 		 441 aa  89  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  31.69 
 
 		 422 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6794  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5580  ABC transporter/Periplasmic pectin oligomer binding protein  31.61 
 
 		 427 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 402 aa  87  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0919  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 		 441 aa  87  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.31 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 454 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  30.92 
 
 		 430 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05420  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0143899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  29.88 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.2 
 
 		 407 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1199  extracellular solute-binding protein family 1  30.29 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000829014 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29730  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.31 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 460 aa  83.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2036  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 439 aa  83.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.182591  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 455 aa  82  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1126  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 432 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.190587  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 410 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1698  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 447 aa  80.1  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.5 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2647  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.890591  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.86 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 503 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 432 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>