More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3543 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  471  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  82.06 
 
 		 229 aa  346  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  50.22 
 
 		 230 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  58.19 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  50.68 
 
 		 223 aa  193  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  59.89 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  50 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  47.79 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  54.03 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  49.76 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  50.75 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  45.83 
 
 		 222 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  51.78 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  45.13 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  47.6 
 
 		 226 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  42.41 
 
 		 226 aa  161  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  43.33 
 
 		 230 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  49.55 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  51.74 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  42.31 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  42.86 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 226 aa  151  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  38.46 
 
 		 226 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  45.58 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  38.76 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 215 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  43.22 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  39.82 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  41.26 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  43.56 
 
 		 225 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 219 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  40.81 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  39.91 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  43.98 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  39.56 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 337 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  42.6 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 225 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  34.91 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  40.69 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  41.71 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  40 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  40.85 
 
 		 216 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  50.28 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  43.64 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  36.28 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  39.8 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  34.2 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  35.94 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  38.36 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 245 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  40.13 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 249 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  36.81 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  36.15 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  36.62 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19650  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 		 221 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.230789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  35.84 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  36.36 
 
 		 249 aa  99  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  38.92 
 
 		 253 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  39.41 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 243 aa  98.6  8e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.05 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  30.81 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  34.06 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 255 aa  96.3  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 218 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.46 
 
 		 257 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  34.72 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  37.02 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  37.11 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  38.1 
 
 		 240 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  39.76 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  34.11 
 
 		 215 aa  95.1  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  38.46 
 
 		 262 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  39.08 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  34.08 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  32.9 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  38.2 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  36.36 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  37.11 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>