More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2714 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 414 aa  847    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  71.36 
 
 		 416 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  58.22 
 
 		 425 aa  450  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1955  extracellular solute-binding protein family 1  51.15 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.974693  hitchhiker  0.000475348 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  49.76 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  47.8 
 
 		 423 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  36.74 
 
 		 420 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  35.76 
 
 		 445 aa  177  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  35.59 
 
 		 408 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  32.6 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  31.69 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  32.63 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  33.89 
 
 		 417 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0253  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.19 
 
 		 424 aa  136  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 421 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2792  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.199618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0630  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 		 410 aa  120  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.505283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.19 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.23 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.23 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 414 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  31.99 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  29.6 
 
 		 443 aa  103  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 		 456 aa  99.8  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.62 
 
 		 438 aa  99  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.23 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  30.34 
 
 		 431 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 424 aa  97.1  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 415 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.81 
 
 		 406 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 		 432 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  26.82 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 424 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.48 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 421 aa  94  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 435 aa  93.6  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 445 aa  93.2  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.33 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 418 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.33 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 437 aa  92.4  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.45 
 
 		 426 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.74 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  27.74 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 411 aa  90.5  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4496  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.74 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.74 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.74 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4586  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.74 
 
 		 396 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.44 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.77 
 
 		 407 aa  89.7  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  28.86 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 417 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 415 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 401 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 415 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  31.11 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.36 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4623  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.59 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.108824 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4572  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.59 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0168981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4421  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.59 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100315 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.78 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4571  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.59 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.552535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 430 aa  87  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.42 
 
 		 419 aa  87  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.6 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4486  maltose ABC transporter periplasmic protein  27.63 
 
 		 396 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.6 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  25.6 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  25.84 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.8 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000108283  decreased coverage  0.000897425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>