233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0029 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  61.25 
 
 		 549 aa  651    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  61.34 
 
 		 550 aa  659    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  60.14 
 
 		 552 aa  646    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  59.96 
 
 		 552 aa  645    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  62.36 
 
 		 549 aa  676    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  100 
 
 		 548 aa  1108    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  50.27 
 
 		 575 aa  543  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  49.73 
 
 		 550 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  46.78 
 
 		 563 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  46.89 
 
 		 559 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  48.2 
 
 		 563 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  43.14 
 
 		 548 aa  418  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  45.72 
 
 		 567 aa  418  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  43.7 
 
 		 552 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  45.35 
 
 		 603 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  42.97 
 
 		 555 aa  402  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  44.72 
 
 		 571 aa  404  1e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  42.96 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  41.55 
 
 		 547 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  41.65 
 
 		 557 aa  393  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  42.37 
 
 		 557 aa  392  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  42.15 
 
 		 546 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  41.47 
 
 		 557 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  40.83 
 
 		 552 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  43.07 
 
 		 542 aa  390  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  43.44 
 
 		 522 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  42.96 
 
 		 551 aa  389  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  42.03 
 
 		 556 aa  389  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  40.47 
 
 		 558 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  40.11 
 
 		 558 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  40.47 
 
 		 558 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  40.11 
 
 		 558 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  41.09 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  39.26 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  39.07 
 
 		 541 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  40.15 
 
 		 529 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  41.07 
 
 		 552 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  39.75 
 
 		 557 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  38.75 
 
 		 541 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  40.07 
 
 		 529 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  38.63 
 
 		 532 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  38.69 
 
 		 540 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  38.87 
 
 		 540 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  38.87 
 
 		 540 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  39.22 
 
 		 597 aa  365  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  38.62 
 
 		 532 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  39.2 
 
 		 506 aa  362  8e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  38.32 
 
 		 549 aa  362  8e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  39.35 
 
 		 528 aa  362  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  37.18 
 
 		 550 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  36.29 
 
 		 537 aa  343  7e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  36.1 
 
 		 573 aa  307  3e-82  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  35.71 
 
 		 573 aa  303  8.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  37.71 
 
 		 563 aa  299  9e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  32.66 
 
 		 529 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  33.6 
 
 		 506 aa  220  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  31.54 
 
 		 539 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  32.28 
 
 		 552 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  32.03 
 
 		 551 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  29.06 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  30.74 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  30.04 
 
 		 558 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  28.7 
 
 		 545 aa  176  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  27.76 
 
 		 560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  31.31 
 
 		 534 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  28.52 
 
 		 528 aa  146  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  28.54 
 
 		 533 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  30.14 
 
 		 531 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  27.95 
 
 		 506 aa  144  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  27.7 
 
 		 598 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  26.83 
 
 		 674 aa  142  1.9999999999999998e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  27.27 
 
 		 546 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  26.63 
 
 		 539 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  26.46 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  28.76 
 
 		 579 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  28.73 
 
 		 503 aa  124  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  34.4 
 
 		 334 aa  113  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  37.37 
 
 		 341 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2188  M23B family peptidase  35.57 
 
 		 490 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.558201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  31.58 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  27.43 
 
 		 944 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  32.87 
 
 		 319 aa  97.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  35.91 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  29.45 
 
 		 623 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  33.51 
 
 		 394 aa  90.9  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31.36 
 
 		 407 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  30.56 
 
 		 301 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  46.02 
 
 		 330 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  29.63 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  27.88 
 
 		 325 aa  83.6  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  33.64 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  32.56 
 
 		 346 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  31.58 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  43.48 
 
 		 1103 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  29.81 
 
 		 319 aa  80.1  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  33.53 
 
 		 420 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  30 
 
 		 555 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  34.24 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  30.91 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1093  peptidase M28  27.42 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>