More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1492 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1492  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  433  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8769  putative transcriptional regulator, TetR family  51.2 
 
 		 202 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  46.89 
 
 		 198 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  47.87 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  40.93 
 
 		 210 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 		 195 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 190 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3751  putative transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0636766  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  35.64 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5669  regulatory protein TetR  30.05 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2010  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.267977  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 189 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 286 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  27.21 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 216 aa  50.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  37.8 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3899  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0449568  normal  0.0930409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 251 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1067  TetR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 221 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 332 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  47.17 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00620  Transcriptional regulatory protein, TetR family  32.53 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1086  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.535417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  35.38 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  35.38 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2680  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 198 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.291962  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  29.9 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  30.3 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>