More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1574 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  64.22 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  62.1 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  61.93 
 
 		 238 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  48.4 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50 
 
 		 232 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  49.07 
 
 		 234 aa  211  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  48.65 
 
 		 234 aa  209  3e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  50.48 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  52.38 
 
 		 233 aa  199  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  52.58 
 
 		 231 aa  197  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  46.95 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  48.65 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 228 aa  194  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  47.93 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  51.15 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  48.56 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  46.95 
 
 		 461 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  47.71 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  48.39 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  42.79 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  44.64 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  44.64 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  44.64 
 
 		 233 aa  176  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  41.2 
 
 		 227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  40.87 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 		 222 aa  148  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  40.82 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  40.09 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  44.34 
 
 		 232 aa  141  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  38.36 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  40.72 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  36.36 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  40.27 
 
 		 229 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  35.5 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  33.97 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  33.92 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  39.24 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  39.63 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 216 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  40.31 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.91 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  37.26 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 		 217 aa  122  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  36.41 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  36.04 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  34.62 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  36.95 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  33.78 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.13 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.9 
 
 		 222 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  35.59 
 
 		 218 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  38.81 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 		 238 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  36.04 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  35.34 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  35.21 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  34.91 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  35 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  37.23 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 225 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 218 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  34.91 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 		 227 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 225 aa  114  8.999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  34.84 
 
 		 272 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  35.19 
 
 		 223 aa  114  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  34.91 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  38.02 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  34.6 
 
 		 221 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  34.62 
 
 		 233 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>