106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3814 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3814  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 359 aa  724    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000186749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  35.85 
 
 		 963 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  34.7 
 
 		 1051 aa  139  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  34.52 
 
 		 1026 aa  139  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  34.13 
 
 		 1292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  33.55 
 
 		 1130 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  33.55 
 
 		 439 aa  132  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  34.71 
 
 		 646 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1750 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  33.87 
 
 		 2296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  31.49 
 
 		 1030 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  30.03 
 
 		 1763 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1351 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  31.33 
 
 		 892 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 		 850 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.82 
 
 		 693 aa  87.8  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0842  YD repeat-containing protein  30.99 
 
 		 2831 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  26.35 
 
 		 772 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  24.43 
 
 		 588 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  30.58 
 
 		 807 aa  77  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  27.02 
 
 		 831 aa  77  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0044  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 		 863 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0701705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  28.79 
 
 		 1140 aa  73.2  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.97 
 
 		 668 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.37 
 
 		 930 aa  71.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1156  YD repeat-containing protein  34.47 
 
 		 2961 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  27.8 
 
 		 346 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  26.77 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  28.53 
 
 		 652 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1291  hypothetical protein  37.93 
 
 		 510 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.984868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.42 
 
 		 930 aa  65.1  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  24.44 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  27.36 
 
 		 1046 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1280  NHL repeat-containing protein  26.26 
 
 		 504 aa  62.8  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.164299  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  24.66 
 
 		 841 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0567  NHL repeat containing protein  34.29 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00166551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  25.71 
 
 		 805 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  25.19 
 
 		 676 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  24.32 
 
 		 709 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1718  NHL repeat-containing protein  29.06 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  23.83 
 
 		 752 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  29.74 
 
 		 732 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  27.4 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  24.92 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  38.53 
 
 		 1916 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3670  NHL repeat-containing protein  26.13 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1286  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.96 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4185  serine/threonine protein kinase  23.25 
 
 		 719 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00583  hypothetical protein  27.42 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  27.38 
 
 		 756 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3914  NHL repeat-containing protein  32.94 
 
 		 672 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  22.9 
 
 		 322 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.7 
 
 		 307 aa  55.5  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  24.74 
 
 		 770 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  28.03 
 
 		 627 aa  54.7  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3618  hypothetical protein  23.74 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  23.91 
 
 		 321 aa  53.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  21.88 
 
 		 2350 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  26.4 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  25.41 
 
 		 1293 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2329  NHL repeat containing protein  41.98 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716797  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0567  Redoxin domain protein  25.76 
 
 		 498 aa  51.2  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6443  NHL repeat containing protein  38.95 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  23.7 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3716  NHL repeat containing protein  28.32 
 
 		 674 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  25.5 
 
 		 1163 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1791  NHL repeat containing protein  22.19 
 
 		 425 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.326453  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  37.23 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0027  Fibronectin type III domain protein  31.06 
 
 		 460 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  33.71 
 
 		 343 aa  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  25 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  23.19 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1402  NHL repeat containing protein  32.48 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.649211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  23.53 
 
 		 579 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  27.64 
 
 		 353 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0908  gluconolactonase  31.52 
 
 		 342 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.17943 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  23.58 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  29.61 
 
 		 525 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  23.26 
 
 		 786 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  32.22 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4099  NHL repeat containing protein  28.64 
 
 		 581 aa  47.4  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.649178  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  24.77 
 
 		 379 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  26.09 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  25.25 
 
 		 1146 aa  47  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  26.24 
 
 		 447 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  25.35 
 
 		 491 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  41.54 
 
 		 641 aa  46.6  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  26.53 
 
 		 950 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0173  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28 
 
 		 639 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  27.66 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2141  hypothetical protein  25.84 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2644  hypothetical protein  25.11 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0696665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  22.5 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  29.23 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  22.87 
 
 		 347 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  27.87 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  36.11 
 
 		 319 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  26.42 
 
 		 660 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47490  hypothetical protein  29.27 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4098  hypothetical protein  29.03 
 
 		 353 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>