More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2627 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1822  TonB-dependent receptor, putative  77.34 
 
 		 936 aa  1493    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1516  TonB-dependent receptor  90.3 
 
 		 933 aa  1733    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1655  TonB-dependent receptor  75.66 
 
 		 930 aa  1467    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375074  normal  0.0861797 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2722  TonB-dependent receptor  75.88 
 
 		 930 aa  1469    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000264454  hitchhiker  0.00000515529 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2720  TonB-dependent receptor  75.93 
 
 		 935 aa  1471    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000443965  decreased coverage  0.0000000374921 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1623  TonB-dependent receptor  75.93 
 
 		 935 aa  1471    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000685263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1659  TonB-dependent receptor  75.93 
 
 		 935 aa  1471    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000155568  normal  0.103819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2627  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 937 aa  1916    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000622883  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1621  TonB-dependent receptor  75.66 
 
 		 930 aa  1467    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00153762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02820  TonB-dependent receptor  40.1 
 
 		 935 aa  627  1e-178  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00655846  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2535  TonB-dependent receptor  35.79 
 
 		 966 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00182165  unclonable  0.0000531763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3309  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 981 aa  494  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.018449  normal  0.497623 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5429  TonB-dependent receptor  35.23 
 
 		 1088 aa  475  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0208974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 953 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3082  TonB-dependent receptor  34.6 
 
 		 965 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000538952  decreased coverage  0.0000060064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  34.71 
 
 		 853 aa  457  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2427  TonB-dependent receptor, plug  34.05 
 
 		 966 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000018893  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 		 853 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 		 853 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 853 aa  459  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 		 853 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  32.96 
 
 		 869 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  33.76 
 
 		 841 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 838 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 843 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  34.04 
 
 		 836 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  33.51 
 
 		 839 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 855 aa  436  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2467  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 907 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000162909  hitchhiker  0.00002571 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1252  TonB-dependent receptor  33.16 
 
 		 907 aa  436  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000104446  unclonable  0.0000165135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2861  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 873 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.318133  hitchhiker  0.0000000966582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2416  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 842 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3321  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 987 aa  429  1e-118  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.64896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 855 aa  428  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3061  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 985 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00588952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1784  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 873 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.942088  hitchhiker  0.0000219382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0250  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 952 aa  419  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.117103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3556  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 944 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02600  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 981 aa  405  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3083  TonB-dependent receptor  32.73 
 
 		 912 aa  405  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000522801  decreased coverage  0.000005339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0820  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 975 aa  400  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0819  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 		 974 aa  399  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.712019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1633  TonB-dependent receptor  32.76 
 
 		 938 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  34.94 
 
 		 709 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 904 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 904 aa  379  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 817 aa  376  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 904 aa  376  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 904 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2411  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 901 aa  367  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.135227  normal  0.143367 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 897 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2471  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 957 aa  364  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.464894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2373  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 966 aa  360  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3757  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 924 aa  357  5.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.19794  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1674  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 951 aa  348  3e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.215373  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01457  TonB-dependent outer membrane receptor  29.62 
 
 		 914 aa  344  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11221  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3424  TonB-dependent receptor  30.76 
 
 		 944 aa  342  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00012336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  30.55 
 
 		 869 aa  334  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2653  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 948 aa  332  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0810982  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4165  TonB-dependent receptor  30.67 
 
 		 947 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00322624  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1632  TonB-dependent receptor, plug  28.54 
 
 		 929 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000717844  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01035  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 946 aa  328  2.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 875 aa  325  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0124  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 951 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000377031  unclonable  0.0000000000937896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3760  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 967 aa  315  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.155087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2480  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 876 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00179427  hitchhiker  0.0000950091 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3385  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 910 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1569  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 869 aa  310  9e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000550471  decreased coverage  0.0000000582733 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2469  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 891 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2404  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 872 aa  303  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1868  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 935 aa  300  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31102  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2653  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 940 aa  299  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 852 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0679  putative TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 1009 aa  291  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1696  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 924 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.438223  hitchhiker  0.000325998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2767  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 924 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0740261 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2688  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 924 aa  290  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161731  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 861 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3753  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 861 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000402099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3562  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 861 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000011652  normal  0.26922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2119  TonB-dependent receptor  28.6 
 
 		 890 aa  289  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.817127  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1859  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 890 aa  288  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 861 aa  288  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2628  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 868 aa  287  5.999999999999999e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000198241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 861 aa  287  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 861 aa  286  9e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1914  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 890 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 855 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4293  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 973 aa  285  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.138795  normal  0.297709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2385  TonB-dependent receptor, plug  28.42 
 
 		 895 aa  283  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000246068  hitchhiker  0.00510046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1503  outer membrane receptor protein  28.89 
 
 		 899 aa  283  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1426  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 969 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.332394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1810  TonB-dependent receptor, plug  27.82 
 
 		 961 aa  281  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0488165  normal  0.142718 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2263  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 1015 aa  280  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.938234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2885  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 1007 aa  279  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.998185  hitchhiker  0.000000100391 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2967  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 1007 aa  278  5e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.325613  unclonable  0.000074765 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1309  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 1007 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3063  phosphatidylglycerophosphatase  28.08 
 
 		 1007 aa  274  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.429935  hitchhiker  0.00000353184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2875  TonB-dependent receptor plug  27.53 
 
 		 896 aa  273  9e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01666  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.25 
 
 		 969 aa  273  9e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>