More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22630 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  424  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  21.2 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  26.11 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  21.4 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  21.79 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000134359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  19.1 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  24.6 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2431  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 278 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 268 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3021  regulatory protein, TetR  29.49 
 
 		 205 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.84883  normal  0.636371 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 240 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 183 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  36.62 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  36.51 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  23.19 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  23.19 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  23.19 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  23.19 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  23.77 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  23.19 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  23.19 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  23.19 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  42.55 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  23.19 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>