More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0451 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  454  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 205 aa  62  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0544  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000992558 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  37.33 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.4 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  31.07 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  38.37 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1262  hypothetical protein  27.68 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.683399  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  32 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  29.17 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 272 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 242 aa  48.9  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 220 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 272 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  31.86 
 
 		 258 aa  48.5  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4541  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0842313  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4616  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 174 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 316 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  28.32 
 
 		 145 aa  46.6  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 209 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>