201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2650 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  40.71 
 
 		 1314 aa  872    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  36.59 
 
 		 1309 aa  700    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 1311 aa  2622    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  42.17 
 
 		 1324 aa  937    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  32.13 
 
 		 1326 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  32.75 
 
 		 845 aa  345  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  32.06 
 
 		 838 aa  344  7e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  31.28 
 
 		 843 aa  333  1e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  49.84 
 
 		 1046 aa  330  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  30.98 
 
 		 1500 aa  328  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  30.8 
 
 		 849 aa  303  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  30.44 
 
 		 1383 aa  295  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  29.68 
 
 		 1523 aa  278  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  32.98 
 
 		 897 aa  263  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  30.08 
 
 		 1509 aa  255  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  31.66 
 
 		 900 aa  254  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  32.29 
 
 		 1000 aa  253  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  34.8 
 
 		 675 aa  252  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  33.67 
 
 		 859 aa  243  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  31.67 
 
 		 992 aa  242  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  31.85 
 
 		 829 aa  241  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1010 aa  231  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 911 aa  216  2.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  27.95 
 
 		 934 aa  211  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  27.84 
 
 		 899 aa  196  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  27.45 
 
 		 963 aa  192  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  24.17 
 
 		 1262 aa  189  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 785 aa  188  5e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  27.83 
 
 		 1056 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  26.56 
 
 		 1261 aa  177  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  25.78 
 
 		 1185 aa  174  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  24 
 
 		 1288 aa  169  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1039 aa  165  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  28.02 
 
 		 713 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  24.57 
 
 		 1125 aa  154  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  25.22 
 
 		 1128 aa  154  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 		 1105 aa  143  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 1088 aa  141  8.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  28.81 
 
 		 686 aa  136  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  27.31 
 
 		 801 aa  134  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1017 aa  133  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  31.7 
 
 		 837 aa  131  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  26.55 
 
 		 1488 aa  129  4.0000000000000003e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  27.64 
 
 		 1050 aa  119  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 857 aa  118  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  23.99 
 
 		 1131 aa  117  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.35 
 
 		 1068 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.28 
 
 		 1283 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  34.66 
 
 		 373 aa  117  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  31.9 
 
 		 924 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 454 aa  113  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  27.03 
 
 		 828 aa  113  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  29.54 
 
 		 385 aa  109  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.91 
 
 		 1424 aa  108  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 		 1186 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 953 aa  103  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.58 
 
 		 767 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20.87 
 
 		 1404 aa  99.8  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 843 aa  95.9  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3282  chromosome partitioning ATPase  31.88 
 
 		 476 aa  95.5  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.24711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2817  chromosome partitioning ATPase  31.4 
 
 		 472 aa  95.5  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  23.38 
 
 		 1040 aa  94.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  26.41 
 
 		 568 aa  94  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.41 
 
 		 568 aa  94  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.78 
 
 		 841 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 		 776 aa  93.2  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  21.84 
 
 		 822 aa  92.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 1215 aa  92.4  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  21.82 
 
 		 1146 aa  92  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  28.21 
 
 		 1328 aa  90.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 284 aa  90.1  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  23.2 
 
 		 1136 aa  89  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  20.35 
 
 		 1550 aa  88.2  9e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.61 
 
 		 991 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  30.99 
 
 		 702 aa  88.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.12 
 
 		 885 aa  87.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 		 814 aa  84  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  26.11 
 
 		 825 aa  82.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 		 966 aa  82.4  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 751 aa  82  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 949 aa  82  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  26.39 
 
 		 1475 aa  81.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  25.73 
 
 		 577 aa  80.5  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  20.17 
 
 		 1212 aa  80.5  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0869  hypothetical protein  26.14 
 
 		 902 aa  79.7  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  25 
 
 		 799 aa  79  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.56 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  26.07 
 
 		 1106 aa  77  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.87 
 
 		 919 aa  75.5  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.01 
 
 		 771 aa  74.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  27.17 
 
 		 672 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  28.51 
 
 		 680 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  19.57 
 
 		 2145 aa  73.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  26.22 
 
 		 457 aa  73.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  30.33 
 
 		 911 aa  73.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  25.63 
 
 		 793 aa  72.8  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  29.86 
 
 		 956 aa  71.6  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 481 aa  71.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  24.81 
 
 		 1468 aa  70.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>