More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2499 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2849  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  82.24 
 
 
961 aa  1588    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230006  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2499  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  100 
 
 
957 aa  1912    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.628106  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.11 
 
 
1480 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.78 
 
 
1332 aa  488  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
2153 aa  275  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
2161 aa  250  7e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.59 
 
 
3470 aa  238  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.01 
 
 
1004 aa  211  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  30.56 
 
 
1017 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  43.24 
 
 
521 aa  198  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  34.72 
 
 
438 aa  196  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
2783 aa  182  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  35.06 
 
 
400 aa  181  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  29.52 
 
 
584 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  37.7 
 
 
563 aa  181  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  37.79 
 
 
366 aa  177  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  39.59 
 
 
1087 aa  167  6.9999999999999995e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  41.5 
 
 
365 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  40.62 
 
 
361 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.29 
 
 
995 aa  165  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  34.78 
 
 
477 aa  164  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.69 
 
 
480 aa  162  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  39.18 
 
 
1087 aa  162  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 
497 aa  161  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  39.43 
 
 
649 aa  159  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  38.37 
 
 
716 aa  158  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  34.77 
 
 
631 aa  158  6e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  28.99 
 
 
566 aa  156  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  37.65 
 
 
687 aa  156  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  34.31 
 
 
445 aa  155  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  37.45 
 
 
413 aa  154  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3716  protein serine/threonine phosphatase  34.16 
 
 
474 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.412464  normal  0.388868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3662  protein serine/threonine phosphatase  34.16 
 
 
474 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.12 
 
 
748 aa  152  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  29.41 
 
 
459 aa  152  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0729  protein serine/threonine phosphatase  37.6 
 
 
364 aa  152  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.950002  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  38.8 
 
 
455 aa  151  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.79 
 
 
590 aa  151  6e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  35.54 
 
 
708 aa  151  7e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  35.49 
 
 
463 aa  150  9e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  33.94 
 
 
445 aa  150  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.66 
 
 
507 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  35.51 
 
 
1079 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  36.68 
 
 
684 aa  148  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  33.84 
 
 
846 aa  147  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
637 aa  146  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  35.83 
 
 
706 aa  145  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2554  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.05 
 
 
997 aa  145  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1587  protein serine/threonine phosphatase  34.69 
 
 
460 aa  145  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.94 
 
 
678 aa  144  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  36.84 
 
 
649 aa  143  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  37.07 
 
 
1100 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  37.75 
 
 
775 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  36.25 
 
 
376 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  33.47 
 
 
410 aa  142  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  35.22 
 
 
1083 aa  141  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  35.51 
 
 
1082 aa  139  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  33.86 
 
 
379 aa  139  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  28.08 
 
 
443 aa  138  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  34.84 
 
 
469 aa  138  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.64 
 
 
482 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  26.11 
 
 
464 aa  137  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2919  putative PAS/PAC sensor protein  31.81 
 
 
581 aa  137  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.93 
 
 
467 aa  137  9e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.34 
 
 
516 aa  137  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  32.68 
 
 
683 aa  135  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.22 
 
 
572 aa  134  6e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  35.74 
 
 
853 aa  134  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  25.86 
 
 
454 aa  134  7.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  35.51 
 
 
486 aa  134  7.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0662  response regulator receiver (CheY) and GAF modulated Serine phosphatase  35.88 
 
 
557 aa  134  9e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00161844  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  33.06 
 
 
536 aa  134  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  34.63 
 
 
637 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  38.19 
 
 
563 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  36.96 
 
 
705 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  32.48 
 
 
470 aa  133  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  33.92 
 
 
474 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  34.14 
 
 
644 aa  133  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  34.42 
 
 
340 aa  133  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  29.47 
 
 
423 aa  131  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  25.57 
 
 
612 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  31.28 
 
 
642 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  36.48 
 
 
543 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  32.74 
 
 
465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.74 
 
 
465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
1527 aa  129  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  34.9 
 
 
451 aa  129  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2839  GAF(s) sensor(s)-containing protein serine phosphatase  34 
 
 
557 aa  129  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  34.04 
 
 
462 aa  128  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0195  sigma factor sigB regulation protein  29.81 
 
 
683 aa  127  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
1527 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  33.71 
 
 
754 aa  127  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  30.65 
 
 
630 aa  126  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  31.54 
 
 
396 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  28.21 
 
 
533 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0446  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
1527 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.5 
 
 
447 aa  125  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  33.98 
 
 
648 aa  124  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.39 
 
 
385 aa  124  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  32.16 
 
 
447 aa  124  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>