More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1770 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  100 
 
 		 308 aa  617  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  49.5 
 
 		 305 aa  301  8.000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  48.21 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 369 aa  294  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  48.69 
 
 		 305 aa  286  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 315 aa  286  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  45.45 
 
 		 315 aa  282  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  44.44 
 
 		 308 aa  281  8.000000000000001e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  48.4 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  48.4 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  47.56 
 
 		 299 aa  280  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  46.47 
 
 		 316 aa  279  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  47.56 
 
 		 319 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  47.23 
 
 		 310 aa  279  5e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  46.28 
 
 		 317 aa  275  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  49.51 
 
 		 306 aa  275  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  46.73 
 
 		 316 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  48.21 
 
 		 307 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  46.47 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  48.03 
 
 		 322 aa  271  8.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  45.66 
 
 		 331 aa  271  8.000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  46.13 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  45.6 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 		 307 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  45.13 
 
 		 328 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  44.77 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  46.1 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  57.8 
 
 		 236 aa  262  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  55.26 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.95 
 
 		 301 aa  259  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  45.42 
 
 		 339 aa  254  9e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  45.75 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  46.15 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  44.63 
 
 		 310 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  44.16 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 336 aa  248  9e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  44.66 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 		 308 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  53.6 
 
 		 235 aa  241  7.999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  50.45 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  43.04 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  41.23 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  41.61 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  52.29 
 
 		 261 aa  227  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  38.19 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  37.91 
 
 		 309 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  37.91 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  40.91 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 309 aa  219  7e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  40.52 
 
 		 331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  36.93 
 
 		 314 aa  215  7e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  39.03 
 
 		 308 aa  210  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  38.22 
 
 		 327 aa  209  7e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  44.08 
 
 		 247 aa  202  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  36.04 
 
 		 309 aa  202  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.56 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 356 aa  199  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  46.15 
 
 		 578 aa  199  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.76 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.72 
 
 		 316 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  33.97 
 
 		 315 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  33.76 
 
 		 319 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.22 
 
 		 308 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  38.43 
 
 		 293 aa  195  6e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  37.82 
 
 		 303 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 302 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.82 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  37.82 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  34.53 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  40.62 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  41.74 
 
 		 575 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  37.5 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  36.62 
 
 		 321 aa  192  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  36.66 
 
 		 316 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.86 
 
 		 337 aa  192  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  45.45 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  45.21 
 
 		 594 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  36.98 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  36.86 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  36.48 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  42.16 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  38.51 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  33.85 
 
 		 328 aa  190  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.25 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.52 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  34.95 
 
 		 310 aa  188  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  40.91 
 
 		 590 aa  186  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  39.81 
 
 		 311 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.81 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  38.39 
 
 		 310 aa  185  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.4 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  38.58 
 
 		 576 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  38.58 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  40.5 
 
 		 590 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  36.96 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.72 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>