More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 299 aa  610  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  74.05 
 
 		 291 aa  424  1e-118  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  65.73 
 
 		 293 aa  399  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  48.95 
 
 		 296 aa  295  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  44.98 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  43.1 
 
 		 290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  42.52 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 		 282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  47.16 
 
 		 284 aa  250  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  43.17 
 
 		 289 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 286 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  40.69 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  40.41 
 
 		 292 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  40.41 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  40.41 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  40.41 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  44.1 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  39.37 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  44.64 
 
 		 286 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 292 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  43.2 
 
 		 290 aa  219  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 287 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  39.86 
 
 		 307 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  39.44 
 
 		 303 aa  215  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 288 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  39.72 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  38.46 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  39.93 
 
 		 300 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  36.46 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  40.42 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  42.96 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  39.45 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  38.91 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.4 
 
 		 308 aa  185  7e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  41.9 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  41.9 
 
 		 302 aa  185  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  36.52 
 
 		 289 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  40.89 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  41.53 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  46.15 
 
 		 267 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  39.09 
 
 		 255 aa  169  6e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  38.36 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  38.03 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  42.45 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  35.17 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  34.63 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  36 
 
 		 316 aa  162  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  30.94 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  34.01 
 
 		 317 aa  157  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  34.4 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  35.81 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  40.28 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.59 
 
 		 325 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  35.85 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.36 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  36.32 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  32.89 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  35.41 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  34.51 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  32.47 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  31.11 
 
 		 328 aa  153  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  34.05 
 
 		 360 aa  152  4e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  32.99 
 
 		 298 aa  153  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  37.32 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  33.6 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  37.26 
 
 		 306 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  37.21 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  29.45 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  33.2 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  30 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  32.55 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  37.74 
 
 		 325 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  31.64 
 
 		 339 aa  150  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  32.18 
 
 		 308 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0296  ABC transporter related  39.54 
 
 		 949 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.762546  normal  0.11249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  39.44 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1408  ABC transporter related  37.39 
 
 		 303 aa  149  7e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.021534 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  39.58 
 
 		 291 aa  149  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  36.62 
 
 		 336 aa  149  8e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  39.25 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  30.79 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  35.85 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  31.67 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  33.08 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.68 
 
 		 234 aa  147  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.61 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  33.11 
 
 		 312 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25840  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.06 
 
 		 944 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.128345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  37.26 
 
 		 246 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3884  ABC transporter related  34.8 
 
 		 240 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 331 aa  146  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.85 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  26.83 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  34.85 
 
 		 303 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>