More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2870 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  100 
 
 
296 aa  578  1e-164  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  48.43 
 
 
286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  48.71 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  40.55 
 
 
307 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  42.52 
 
 
290 aa  209  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  52.73 
 
 
251 aa  202  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.81 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.96 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  38.68 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  40.21 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 
293 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  35.37 
 
 
294 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
299 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  44.52 
 
 
284 aa  193  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  39.48 
 
 
292 aa  191  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  39.48 
 
 
292 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  39.48 
 
 
292 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  39.48 
 
 
292 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  41.88 
 
 
300 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  40.62 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  39.85 
 
 
292 aa  189  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  38.89 
 
 
295 aa  188  9e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  50.44 
 
 
267 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  44.1 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  46.12 
 
 
253 aa  183  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  33.67 
 
 
295 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  38.73 
 
 
292 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  41.52 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  33.97 
 
 
310 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  35.05 
 
 
301 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  34.86 
 
 
290 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  35.35 
 
 
303 aa  169  7e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
287 aa  168  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  40.52 
 
 
288 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  35.91 
 
 
369 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
289 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  39.73 
 
 
320 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  39.73 
 
 
320 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0094  ABC transporter, ATP-binding protein  38.2 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0351427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  39.82 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  37.39 
 
 
360 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48 
 
 
338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  40.34 
 
 
301 aa  162  7e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  37.13 
 
 
328 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  35.15 
 
 
295 aa  160  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  36.32 
 
 
325 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  38.14 
 
 
331 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  41.05 
 
 
329 aa  157  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  36.12 
 
 
306 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  38.01 
 
 
315 aa  155  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.77 
 
 
315 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
308 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  39.81 
 
 
344 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  39.21 
 
 
307 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  38.67 
 
 
322 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  35.93 
 
 
298 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.78 
 
 
325 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.08 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0843722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  38.18 
 
 
240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1414  ABC transporter related  40.91 
 
 
263 aa  152  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.916121 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  31.58 
 
 
309 aa  152  8e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  35.91 
 
 
317 aa  151  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  36.68 
 
 
286 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2578  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
282 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 
297 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  43.06 
 
 
309 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.74 
 
 
317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.93 
 
 
308 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  43.3 
 
 
283 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  38.14 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_717  ABC transporter, ATP-binding protein  38.29 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.308097  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2741  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
297 aa  146  5e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.585521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.2 
 
 
308 aa  146  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0813  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 
248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  36.56 
 
 
308 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  39.11 
 
 
311 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.27 
 
 
319 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  37.71 
 
 
339 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  40.47 
 
 
303 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0350  ABC transporter related  37.09 
 
 
303 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.27 
 
 
282 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0521  ABC transporter related  37.61 
 
 
301 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.342097  normal  0.0263898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  32.61 
 
 
303 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.61 
 
 
325 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  35.45 
 
 
309 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  38.5 
 
 
327 aa  143  3e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.16 
 
 
307 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  38.29 
 
 
316 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7061  ABC transporter related  36.77 
 
 
297 aa  143  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.505096  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  39.09 
 
 
316 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  33.81 
 
 
290 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  37 
 
 
323 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21580  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.48 
 
 
244 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114361  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  39.48 
 
 
301 aa  142  8e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  36.11 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  40.43 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  37.59 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 
307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>