More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1029 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  62.41 
 
 		 292 aa  368  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  60 
 
 		 295 aa  366  1e-100  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  60.55 
 
 		 299 aa  359  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  58.53 
 
 		 293 aa  344  8e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  58.82 
 
 		 300 aa  342  5e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  56.7 
 
 		 292 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  54.33 
 
 		 294 aa  334  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  55.03 
 
 		 292 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  55.03 
 
 		 292 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  55.03 
 
 		 292 aa  332  4e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  54.7 
 
 		 292 aa  330  1e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  44.41 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  40.94 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  41.11 
 
 		 287 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  39.51 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  42.27 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  44.29 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  41.96 
 
 		 284 aa  209  6e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  36.73 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  39.66 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.16 
 
 		 291 aa  206  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.21 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  46.84 
 
 		 286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  37.63 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  38.93 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  35.66 
 
 		 290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  37.06 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  39.26 
 
 		 295 aa  175  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  32.99 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  37.59 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 289 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  34.72 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 		 290 aa  161  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  40.71 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  40.87 
 
 		 337 aa  159  6e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  37.05 
 
 		 240 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.91 
 
 		 411 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  41.63 
 
 		 298 aa  152  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  36.68 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  37.12 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  40.55 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  36.68 
 
 		 338 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1780  multidrug ABC transporter  37.67 
 
 		 337 aa  149  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  37.24 
 
 		 360 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1096  ABC transporter related  34.05 
 
 		 250 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  35.22 
 
 		 337 aa  149  8e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  41.83 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.56 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  40.09 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  37.77 
 
 		 307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  35.71 
 
 		 338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  39.56 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.87 
 
 		 348 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  41.44 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05031  putative multidrug efflux ABC transporter  36.77 
 
 		 337 aa  146  3e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.123969 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  38.43 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  37.04 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 318 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  34.32 
 
 		 315 aa  145  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  37.99 
 
 		 331 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  38.91 
 
 		 305 aa  145  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.43 
 
 		 328 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.9 
 
 		 310 aa  145  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.09 
 
 		 328 aa  144  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  31.41 
 
 		 336 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  36.25 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  36.68 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  34.1 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  35.02 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  38.89 
 
 		 337 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  37.84 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  37.84 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  33.78 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 369 aa  142  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  36.21 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0560  ABC transporter ATP-binding protein  39.19 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  38.71 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  33.33 
 
 		 311 aa  142  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.36 
 
 		 234 aa  142  9e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.451187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  38.7 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  35.68 
 
 		 304 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0496  ABC transporter related  39.19 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  37.12 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  33.12 
 
 		 319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  37.79 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  35.47 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  37.79 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 274 aa  140  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.13 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  38.25 
 
 		 310 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  35.59 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  35.39 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  32.03 
 
 		 325 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  32.8 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>